迈克尔·斯科菲尔德正陷于无望的困境中——他的哥哥林肯·伯罗斯被认定犯有谋杀罪被投入了福克斯河州立监狱的死囚牢。虽然所有的证据都指出林肯就是凶手，迈克尔却坚信兄长是无辜的。林肯的死刑执行日越来越逼近，在没有其他选择的情况下，迈克尔持枪闯入了一家银行，被捕入狱后来到了林肯的身边。身为建筑工程师的迈克尔参与了监狱的改造工程而对这里了若指掌，他设计了史上最完美的越狱计划，入狱的唯一目的就是要把林肯救出生天并还其清白。迈克尔在狱中艰难地准备着越狱计划的同时，意想不到的人和事接连出现在通向自由的道路上。