被称之为「蓝色城区」的未来城市－－在那里，有个每到晚上就停电而被黑暗笼罩的城镇－－「夜之镇」。
夜之镇的少年真田叶直一直在一个叫做须蜂贺运送的快递公司打工。有一天，叶直接触了一件昂贵的货物，一个被称之为「GAD'」的神秘物质。之后，「GAD」自我分裂，吞噬了周遭的金属物，变成了一个巨大的人形机器「铁钢人闪电」。从那天以后，叶直的面前便出现了许多其他的铁钢人操纵者。使用铁钢人「零」进行大肆破坏的刃，与铁钢人「米萨舒米特」一起寻找同伴的上流阶层的女孩爱子，与铁刚人「雷电」一起行动的正义少年拓弥。虽然他们都在使用铁钢人，但是他们的想法却大相径庭。总喜欢寻找危险的人，想要和同伴接触的人，为了正义而战的人。大家有着不同的烦恼，但叶直已经捲入了铁钢人的事件以及要和那些同样拥有巨大人形机器的人们的战斗中。「GAD」，也就是铁钢人，为什么要在他们面前出现？这些拥有铁钢人的少年们的命运齿轮，已经开始转动了…

古い街並みと、多くの自然の残る地方都市。実は、この街（ワンダーランド）を維持しているのは、魔法世界リルムから来ている管理者である「魔法少女」であった。「管理者」である魔法少女の特権は、新しい世界を作り出せること。しかし、今の管理者である魔法少女アニエス・ベル（浅羽嬉子）は、それを良しとせず、母から受け継いだ「古い世界」を維持していたのだった。
魔法少女は、人を好きになり「キス」をする事で、魔法の力を失ってしまう。嬉子は、27歳という年齢でありながら魔法少女であり続けるために、結婚した旦那である浅羽保とのキスを拒み、すれ違いから別居しているのだった。
主人公である神楽巽は、大学の陸上部に所属していたが、怪我のため就職することになり、嬉子の家に下宿することになる。その頃、魔法世界からも、新しい管理者候補として、クルージェ（紅さやか）がやって来るのだった。巽に恋したクルージェは、ちょっと大人な姿に変身し、巽に心を開いていく。
業を煮やした魔法世界リルムの評議会は、古い世界から「新しい世界」へ強制的に移行させようと、嬉子の指輪を奪おうと画策するのであった。　街が消えるという事は、その街にいる「大切な人」も消えてしまう…。
浅羽と嬉子、アニエスと巽、巽とクルージェ…。それぞれの恋愛感情が交錯しながら、ゆっくりと少しずつ、物語は加速していく…。