2001年4月28日晚，衡州市毗临闹市区的范光胡同巷口突发枪案，市公安局主管刑侦的副局长徐国庆（石兆琪饰）接报匆匆赶到现场。警方在调查过程中发现受害人吴天背景极其复杂，与许多人恩怨极深。徐国庆经过分析案情，预感这是一起涉及黑势力团伙恩怨的仇杀事件。
警方展开全面追捕，循江湖恩怨抓捕了一批横行衡州的黑团伙成员，可是都并非“4·28”枪案的幕后杀手。与此同时，“4·28”枪案的制造者刘华强（孙红雷饰）正在加紧筹划实施他的罪恶计划。衡州市某房地产公司老总李丽（江珊饰）听闻吴天被杀的消息心中惊悸万分，约刘华强见面。为了妹妹李梅（刘威葳饰）的安全，李丽提出要带李梅走，但被李梅拒绝。正在警方的调查工作一筹莫展之际，刘华强又把罪恶的目光瞄准了下一个目标。警匪之间的追捕与反追捕，复仇与阻止复仇的较量由此展开。

70多岁的青果老人，近来恍恍惚惚，总是看见50多年前的自己。一个偶然的机会．他遇到一次出殡，而死者正是他年轻时的恋人九翠!老人蹒跚地尾随着出殡的队伍．眼前一片浑浊，他又看见了当年的自己……弯弯的小路上，九翠解开红腰带，缠存青果腰上，为恋人送行。一年过去了。九死一生的青果在夜幕中回到了家乡。可九翠嫁人了，嫁给了乡长、瘫子廖百钧．而日．怀孕了。大磨坊里，九翠和菏果相遇了，她告诉青果．廖百钧正在指挥清乡队的地痞，残暴地杀害和部队失去了联系的红军伤员。血腥和暴力逼迫青果挺起胸膛。他抓来11个罪大恶极、杀害我红军伤员的闪手，愤怒地将他们扔在旋转着的碾盘上。接符。他又冲进_了廖百钧的卧房，用那条红腰带将廖百钧活活勒死。然后，抱起九翠离开了一片火海的廖家大院。大磨坊里，青果急急清理着包什，决定携几翠离开这里。可九翠后退着。残酷的现实，已使她失去了生活的信心。她在绝掣中走进了…顶密林的尼姑庵……“砰，叭!”纸屑升鸭。烟雾弥漫，九翠静静地躺在木棺内，棺盖徐徐落下。“嘭嘭”地钉锤撞击一使青果老人回到了眼前的现实巾，他木小地转过身，颤颤巍巍地朗着飘侈的烟雾走去。走去……

故事发生在1948年，特别调查局要员俞北平（陈建斌 饰）被上级调往青城，奉命调查发生在那里的命案，可实际上，俞北平的真实身份正遭到上级的调查和怀疑，他时时刻刻都处于危险之中。在青城，俞北平遇见了名为林莎（齐溪 饰）的女子，身为美军中尉的她，其真实身份其实是俞北平失散多年的女儿。
俞北平还有一个小女儿名为徐丹妮（朱颜曼滋 饰），此时正在青城上大学的她被卷入了和已婚大学教授的不伦之恋之中无法自拔，与此同时，她和父亲之间的关系亦因为俞北平特殊的身份而陷入了僵局之中。俞北平一边要顺利完成上级交代的任务，一边要和狡猾阴险的敌人周旋，一边还要承受来自至亲的不解和误会，他陷入了苦战之中。

1940年，多方势力盘踞南京，特工金深水（张译 饰）终日周旋于日本军方、汪伪政府和军统之间，如同行走于刀尖一般，有着多重身份的他，在满目疮痍的南京城里小心翼翼地活着，隐藏着真实的自己，也寻找着自己乃至整个民族的生路。直到他遇到了和他一样心怀国仇家恨、却似乎比他更游刃有余的林婴婴（郎月婷 饰），在和她并肩作战与各方势力展开明争暗斗的过程中，于乱世中求生的金深水第一次开始真正地觉醒……

鉴于清水市越来越乱的社会治安，林荫（张嘉译 饰）临危受命，担任了清水市新一届公安局长。赴任途中，他亲手抓获了三个行凶的壮汉，但其中一人却让派出所长赵铁军（李梦男 饰）放跑，加之副局长牛明（赵小锐 饰）不冷不热的态度，让林荫很不是滋味。某夜，市委万书记（徐敏 饰）办公室被盗，林荫立下限期破案的军令状。从此，林荫依靠秦志剑（刘均 饰）、高翔（于俭 饰）等刚正不阿的干警，在市委陈副书记、洪市长支持下，与郑光军（谢钢 饰）和公安内部的腐败势力展开了殊死斗争。神通广大的郑光军游说上层领导，暗示要在清水开赌场，林荫将计就计，制定了行动方案“雷雨行动”，他决定彻查黑势力之后的保护伞……