就快放暑假了，小学生上原康一在放学回家的路上捡到一块大石头。他把石头带回了家，没想到用水一洗，里面竟跳出一只小河童来。小河童对他“咕”的叫了一声，于是康一就给它取名为“小咕”。
小咕会说人类的语言，几百年来他一直被埋在在地下。康一很快就和小咕成了好朋友，他们一起洗澡，一起吃饭，一起睡觉。而其它家庭成员也接受了小咕，小河童成了上原一家的秘密。
一天，小咕提出想回家和伙伴们在一起。康一为了让小咕了解外面的世界，悄悄把它带了出去。小咕发现环境已经面目全非，大吃了一惊，这个不适合就河童生存的地方根本就找不到伙伴。看到小咕难过，康一也不好受。他和小咕一起外出旅行，来到了还保存着河童传说的远野县。两人在美丽的大自然中找到了适合河童生活的地方，小咕愉快地在清澈的河里游了起来，康一也为它高兴。可是，在这里也怎么都找不到其它河童。康一听到村民们说“抓住一只河童能得一千万呢！”，赶忙带着小咕离开了那里。
回到家，康一讶异地撞见了一个小报记者。原来那人听说上原家养着一只河童，一定要拍照。小咕的秘密终于被大家知道了。康一的爸爸被公司勒令一定要让河童上电视。为了上原一家，小咕答应参加电视节目。然而在到场嘉宾里，它看到了一个长得很像杀父凶手的人。就在小咕被恐惧包围的时候，电视节目现场发生了意外。它拼命逃到了外面，然而无论跑到哪里都会看到黑压压的人群。
为了摆脱让它害怕的人类，小咕爬上了东京塔。夏季的烈日照得它精疲力竭。小咕俯瞰着城市，独自低语道：“哪里都找不到一个安静的地方，这里是人类的窝。我已经不行了。我要去爸爸那里……”

蜡笔小新推出的又一剧场版。这次，小新的妈妈美伢时来运转，竟然抽中了特等奖——全家到美丽的布里布里岛国免费6日游！于是，爸爸、妈妈和小新收拾好东西出发了！孰料，旅程中小新竟然遭人绑架了！原来布里布里国的黄金之都埋藏着神奇的宝藏，当地野心勃勃的白蛇党领袖蟒蛇伯爵妄图掠夺宝藏，而打开黄金之都的钥匙就是布里布里国的森凯诺王子。巧合的是，森凯诺王子和小新长得一模一样，于是小新就被当成森凯诺王子遭到了白蛇党的绑架。小新这一次巧妙之旅又将碰到什么新奇古怪的人和事？

这天在小新居住的春日部附近，突然新开了一家叫“20世纪博”的游乐园。游乐园里到处播放着从前20世纪的旧的电视节目和电影，这里，一切都是从前时光的回放。每一个到了这里的大人，都沉浸在过去的旧时光里，而对小孩子来说，这些的东西一点意思都没有。令小新万万想不到的是，进入了游乐园的爸爸妈妈都不在理会其他事情，只是一直沉醉在以往的时光里。城里的大人们都进去了，只剩下了小孩子！这到底是谁的阴谋，小新他们能否粉碎这阴谋？

一天早晨，小新一家人正为了晚上的烧肉大餐而兴奋莫名，却被一名突然闯入的男子打乱了一切，自此原本过著安逸生活的一家人竟成了通缉要犯，还被神秘组织“甜蜜男孩”追讨一项没有人知道是什么的“那个东西”！为了能如原订计划吃到超豪华烧肉大餐，一家人把时间限定在晚餐前，发誓要在这之前找出真相、洗刷冤屈。面对神秘组织设下的重重陷阱与猛烈攻击，野原家所有成员循着蛛丝马迹，使出浑身解数，展出十八般武艺，对抗声势浩大的神秘组织兵团，最后，终于抵达神秘组织的所在地─热海市，并和总部老大有了正面交锋的机会。当老大解开谜题，说出“那个东西”为何时，小新一家人又面临了另一场考验……

某一晚，野原一家同时梦见了古装剧里才会出现的”古代美女”，虽然全家人都觉得很不可思议，却也没有深入追究。当天下午小新从幼儿园回来时，看到小白正在庭院里拼命挖洞，而当小新也跟着开始挖掘后，竟然挖出了一个箱子，里面放有小新亲笔写的书函，除了写有天正2年的字眼外，还画有肥嘟嘟左卫门的图案。小新由于摸不着头绪而闭上眼睛思考，却在睁开眼时发现自己已经身处在一个战国时代，并阴错阳差救了武士，更因此得以见到了梦中的那位美女”阿廉公主…

小新一家还有风间，妮妮，正男，阿呆一起报名动感超人周年纪念南海之旅，就在动感超人电影的船上首映会上，突然出现了一群粗暴的猴子将大人们都掳走了。春日部防卫队为了救出大人们而出动，小新一行人冒险渡海到南海上的一座荒岛希望可以查出发生了什么事，但本应在船上小葵和小白竟突然出现，小新还发现另一辆古怪的船......

某日，小新（矢岛晶子 配音）、小葵和美伢（楢桥美纪 配音）被一群神秘人物绑架，醒来之后发现身处一间神秘的基地之内，原来，这里是名为“温泉G组”的秘密组织，意在保护对于日本来说十分珍贵的温泉。然而，横空出世的污垢达人博士（家弓家正 配音）企图利用“地球温泉计划”将温泉G组彻底击垮。
唯一能够阻止污垢达人博士的阴谋的，就只有仅存在于传说之中的“黄金之魂温泉”，而组员们经过调查，发现该温泉正好处于小新他们家地下。小新一家人决定帮助温泉G组的同胞们找到黄金之魂温泉，却遭到了污垢达人博士的袭击，并且最终沦为俘虏遭受了酷刑。

某日，双叶幼稚园的孩子们正在船屋里愉快的玩耍，一位名叫美色（三石琴乃 配音）的神秘人物忽然现身，紧接着，一艘巨大的飞船将船屋整个抓了起来，来不及逃跑的风间（真柴摩利 配音）和小新（矢岛晶子 配音）等人和飞船一起消失在了空中。
小新的失踪令美伢（楢桥美纪 配音）和广志（藤原启治 配音）感到十分焦急，就在此时，一名代号肌肉（玄田哲章 配音）的男子出现在了两人的身边，很显然，肌肉知道小新的下落和整件事情的来龙去脉，但肌肉并不愿意带着美伢和广志去寻找小新。追寻着细微的线索，美伢和广志得知小新身在香港，两人前往香港，在那里又遇见了肌肉，一行人前往神秘组织“猪蹄组”的老巢。

随着第二次世界大战爆发，日本电影工业第一个黄金时代落下帷幕。出于战争宣传的必要，日本政府以极其苛刻的手段对电影业进行管制，并要求各大电影厂拍摄鼓舞民心和斗志的国策电影。在此期间，已经开始崭露头角的木下惠介（加濑亮 饰）受陆军省的委托拍摄了“大东亚战争三周年纪念作品”——根据火野苇平小说改编的《陆军》。谁知影片的主旨和官方的意向南辕北辙，木下由此遭到禁止拍片的处罚。在此之后，失意的木下从松竹辞职，回到生病的母亲阿玉（田中裕子 饰）身边。战况没有丝毫的好转，曾经恬淡舒适的滨松市气贺也无法久留。木下决定和哥哥敏三（中山裕介 饰）带着母亲前往山中避难。
这是一代大师最失意的瞬间，也是他和家人心与心最为贴近的时刻……

双叶幼稚园的小朋友们来到了高快乐园，在此进行愉快的远足活动。期间，小新（矢岛晶子 配音）在误打误撞之中来到了高快马戏团内，看到了木偶娃娃多佩玛（渊崎有里子 配音）。多佩玛告诉小新，自己被邪恶的乔奇莉诺（室井深雪 配音）施下了诅咒只能在晚上现身，而这个马戏团其实是邪恶的马卡欧（大冢芳忠 配音）和裘马（田中秀幸 配音）两人的老巢，而小新拥有能够将他们打败的扑克牌。
害怕的小新并没有答应帮助多佩玛，第二天，幼稚园新来了一位名叫雪人（古川登志夫 配音）的老师，而雪人来这里的唯一目的，就是夺回小新的扑克牌。很快，笑眯眯胖乎乎的雪人就取得了广志和美伢的信任，并下药将他们迷倒。在这千钧一发之际，小新念出了多佩玛教给他的召唤咒语，打败了雪人。

小新的妈妈美伢时来运转，竟然抽中了特等奖——全家到美丽的布里布里岛国免费6日游！于是，爸爸、妈妈和小新收拾好东西出发了！孰料，旅程中小新竟然遭人绑架了！原来布里布里国的黄金之都埋藏着神奇的宝藏，当地野心勃勃的白蛇党领袖蟒蛇伯爵妄图掠夺宝藏，而打开黄金之都的钥匙就是布里布里国的森凯诺王子。巧合的是，森凯诺王子和小新长得一模一样，于是小新就被当成森凯诺王子遭到了白蛇党的绑架。小新这一次巧妙之旅又将碰到什么新奇古怪的人和事？