网络系统发达都市Den City，那里由大企业SOL技术公司(SOLテクノロジー社)创造的高度网络技术构筑出被称为Link vrains(连接境智网(虚拟实境人工智能网络系统)的VR空间，人们为那VR空间中全新的决斗体验而狂热。

Link vrains出现了通过决斗发起网络入侵的神秘黑客集团汉诺骑士(ハノイの骑士)。他们的目标就是使据说存在于网络某处的属于AI们的世界 = 电子界(サイバース)走向灭亡。

可是跟那场Link vrains面临的威胁进行对抗的还有1名决斗者。他的名字是“Playmaker”。以压倒性的决斗击倒汉诺骑士并一句话也不说就离去后，他的名字就此在网络世界一举成名。

那位“Playmaker”的真正身份高中生藤木游作为了调查过去发生的事件真相，追踪着在Link vrains出没的汉诺骑士。就在日日夜夜跟汉诺骑士展开的激斗之中，游作成功地捕获了SOL技术公司和汉诺骑士都在追寻的神秘AI程序。同时以此事为契机，命运的齿轮开始了大幅度转动……

神秘AI的真面目。盯上电子界的汉诺骑士的真意。以及游作的过去所隐藏的真相——全部的答案，就在Link vrains之中 。

어느 날 갑자기 배달된 소포. 거기에는 「축하드립니다. 당신은 10만분의 1의 확률을 뚫고 라이어 게임에 참가 등록 되셨습니다」 라는 편지와 현금 1억 엔이 들어있었다. 그것이 라이어 게임의 시작이었다. 30일 후 게임 종료일에 자신의 소지금 1억엔을 반환한다. 규칙은 그것뿐. 요령껏 대전상대의 소지금을 빼앗는데 성공하면 승자는 1억 엔을 갖고, 패자는 1억 엔의 빚을 지게 된다… 누구를 믿고, 누구를 믿지 말아야 하는가…