男主角赵贤珉是一名电影导演，女主角姜善熙是一位研究文物的教授，当贤珉将老房子里一部分拆除改造成电影棚时，在一面隐藏的墙后面发现了一个密室，里面有一具女性木乃伊。接获报告到贤珉老家研究此木乃伊的善熙与贤珉就这样认识了，之后贤珉将木乃伊捐赠给了研究所。由于对木乃伊展开的研究，善熙每晚都做着一个同样的梦，有时甚至还出现幻觉，同样的贤珉也出现了一些关于前生的幻觉。在研究所对木乃伊进行DNA检测尝试找出木乃伊的身份时，善熙发现了自己与木乃伊的基因居然完全吻合，这个木乃伊的有关的一段400年前的历史也逐渐被揭开。期间，木乃伊对一切曾有负于她的人展开了报复，这其中也包括了贤珉。

　　原来，这个木乃伊叫做秀熙（善熙的前生？），是赵贤武（贤珉的祖先）的原配妻子。一次被人掳走后侥幸逃回，她的公公婆婆认定了她的不贞而将她赶出家门。贤武之后偷偷将她接回，藏在家中密室并在每天晚上去陪伴秀熙，他承诺将说服自己的父母将秀熙接回。可惜好景不常，贤武最终不敌父母的压迫另取妻子，新婚妻子在某个晚上跟踪贤武发现了秀熙的存在，并将此事告知了公公婆婆。贤武的父母强迫他亲手将密室的进出口门封上，贤武反抗不成后痛苦万分的将密室封上。之后，贤武趁大家都不注意的时候试图回到密室重新将门打开，可是人就被父母发现并将贤武锁在房中。被封在密室的秀熙痛苦绝望，认为是贤武抛弃了她，对其充满怨恨的死去。被囚的贤武自觉愧对秀熙，自缢而死，并在被囚的房中留下遗书。

　 贤珉发现了被自己堂叔藏起的在密室中秀熙的日记，得知了一切原委，他来到研究所看木乃伊。同时，善熙也发现了贤武所留下的遗书并赶回研究所。当善熙赶回时，看到木乃伊站立变回了原本的模样并试图掐死贤珉，而有了前生所有记忆的贤珉完全没有反抗。善熙的及时说出真相，贤珉（贤武）获得了秀熙的原谅。最后，秀熙入土为安与贤武葬在了一起，在四百年之后两人终于圆满了。

홍주성(지금의 홍성)에서 동학란(동학농민운동)이 일어난다. 16세의 몸으로 동학란에 참여를 하는 소년 만해, 1천냥을 탈취하여 군자금으로 보내는 활동을 한다. 55세 성북동에 있는 심우장에서 만해는 재혼(유숙원)을 한다. 아내의 삯바느질 등으로 생활을 영위하면서도 만해는 집필과 함께 창씨 개명 운동 반대, 조선인 학병 출정 반대 운동 등에 참여를 하며 일제에 항거를 계속 한다. 용정명월 백화마담에게서 군자금을 넘겨 받는다. 이화영이 군자금을 만해와 함께 건낸다. 1944년 만해는 66세를 일기로 입적하고 만다. “님의 침묵” 시가 흐르며 만해의 업적이 하이라이트로 소개되면서 자막이 흐른다.