世纪末即将来临，然而，这究竟是地球新的开始，亦或是真正的末日呢？这一切都掌握在“天龙”和“地龙”的手中。平凡而冷漠的少年司狼神威（铃村健一 配音）在某一日拔出了封印在地底的神剑，与此同时，他即将面临一个困难的选择——保护地球成为“天龙”，或是毁灭地球成为“地龙”。14名谜样的男女聚集到了东京的土地上，他们分别是天龙七封印和地龙七御史，这14名身世复杂的男女要为了争夺地球而展开一场残酷的战斗。
神威选择了成为天龙，而出现在他眼前的，地龙的首领居然是自己儿时的挚友桃生封真（诹访部顺一 配音），封真当着神威的面杀死了自己的妹妹小鸟（能登麻美子 配音），从此，两人之间的宿命开始了流转。天龙节节败退，最后仅剩东京铁塔上的结界还在维持着运作，而当此结界被打破时，就是地球的终结之日。被预言必将失败的神威，能否扭转地球的命运？

西歷2017年東京上空突然出現謎之侵入者,其目的一切不明,之後人類與稱之為MU的敵人的超兵器戰鬥,世界各國的軍隊均遭到嚴重的打擊,然而在TOKYO JUPITER形成後地球連軍與敵方形成膠著狀態,直到2027年現在MU的潛在危險仍存在著,地球也持續對抗....... 。

战斗机飞行员函南优一（加濑亮配音）来到基地报道，等待他的是全新的生活环境与熟悉的飞行战斗。在这里，函南优一遇到了各式各样的战友，与不苟言笑的长官草薙水素（菊地凛子配音）。函南优一获得了一架新战斗机，但是，基地里的战友们都对战斗机的前任驾驶员缄默不语。于是函南优一开始留意相关的消息，他渐渐知道，前任驾驶员已经去世，而事件本身与草薙水素有莫大的关系。随着调查的深入，函南优一逐渐发现惊人的真相，而他每天与敌人的战斗，似乎也隐藏着他不知道的意义。

“天使之卵”架构在一个充满阴影和灰暗色彩的超现实主义世界中，剧情的主角是两个没有提及名字的少年与少女。

少女随身带着一颗神秘的蛋，她花许多的时间在某个歌德式的死城里搜集各式瓶子与手工艺品。身上背着一把十字型武器的少年在某天也随着一种神秘的机械来到这个城镇。

同时，巨大腔棘鱼的身影在城镇上方出现，城市里的人也成群的活过来开始用长枪猎捕这些鱼群。

在少女如巨穴般的瓶子中，就像个庇护所一般，里面收藏着蒐藏品。少年等少女入睡后将那颗神秘的蛋打破。

少女表现得很生气并紧跟着已经离开的少年。最后少女沉入了溪谷中死去，她口中吐出来的气泡最后都化作了一颗颗的蛋。

或许能在真正的天空相遇……
1995年9月上映的《超时空要塞PLUS》电影版全长100分钟，基本上是以录像带版再编辑而成，可见录像带版的素质之高。它的空战镜头紧凑、画工精良，但最大的突破在于其大量引入电脑动画，在莎朗的演唱会几乎将电脑动画表现无遗。同时其所使用的配乐十分特殊，有点类似宗教的圣乐。在篇头的清唱版（Voices）配以青绿的风景，带给人无上的意境，就像在倾吐一段思念、一段无尽的心事一般。
第一个词语是梦想棗
从沉睡中，把我内心的秘密悄悄地带出来。
第二个词语是风棗
告诉我前方的路，让我摆动翅膀飞向上苍。
悲伤的往事，随着时光流逝，
金色的苹果又有一个掉下来……
在那遥远的地方，有我从未见过的景象，
那最终的归宿，正等待着第一个生命的造访。
在这月色幽静的夜晚，抱着将来能遇到的预感；
在这月色幽静的夜晚，把古老的魔法在心中咏唱。
You Can Fly
We Have Dreams；
We Can Tonch
Your Dreams；
Only Fly，So Far
To the Wind，In the Night。
第三个词语是……
侧耳倾听你温柔的话语，你的手臂为何颤抖　。
请你把它举起，
请勇敢的朝向我，把它向我开放。
碧蓝的天空下，是一望无垠的绿色草原，洁白的风车轻轻转动着，仿佛在侧耳倾听这支少女心底的歌。和着旋律，风翩翩起舞，两个少年踏着自制的人力滑翔机，像是要追逐风的脚步一样疾驰而过，借着一瞬的上升气流爬上了天际。绿发的少年摔倒在地
上，望着天空中的伙伴，露出了微笑，红发的少年全神贯注的凝视前方，与滑翔机一起溶入天空，投进风的怀抱，像一只展翅飞翔的翼手龙，徐徐飞向远方……
2013年4月，近距离移民船团开始依序出发，搜巡在太阳系周围100光年内的移民星球并定居。11月，在距太阳系11.7光年的恒星系中，发现了第一颗适合人类居住的行星命名为"伊甸"。
2040年，经过了近三十余年的星际殖民，地球棗天顶星联合政府已经控制了相当广大的星域，在为数众多的殖民地里，普罗多人的后裔们已经融合在了一起，微缩后的天顶星人与地球人杂居，经过两代的混血成为了一个种族。殖民地间偶有小规模的摩擦，也都大可以在控制范围以内得到调停。总体来说，社会已经进入了平稳发展的阶段，但是在那些边缘的地带，在那些尚未开发的星域里却也时常会有零星的战斗爆发。
在某个边缘的小行星带一个小队的变形战斗机正与一些天顶星逃兵冲突，此时的地球军早已将VF－11式战斗机作为凡用机来使用，比起从前的战机，VF－11无论是在性能还是火力上都有了质的飞跃，强大的火力配置可以在一瞬间毁灭整支部队。天顶星兵驾驶的则是POD的改进型PODⅡ，这是天顶星军中口碑相当不错的装甲，它的原型POD更是在第一次宇宙大战中出尽了风头，传说当年天顶星一级飞行员米丽娅就是乘着这种战机冲锋陷阵，所向披靡。但是再厚重的装甲也有被击穿的可能，再强大的火力瞄不准目标也是白搭，不管技术怎样革新，对于一架战机来说最重要的部件还是飞行员。在那些王牌机师面前，机种的优劣有时是可以忽略不记的，正因为如此，这场本来势均力敌的空中聚会被一架地球战机打乱了规矩，弄得乱七八糟。像是在表演杂技，这架VF－11不辞辛苦的做着各种高难动作，有意无意的避开一串串子弹，有时他会突然闯入队友的瞄准器里，抢先击落敌机，有时他竟敢隔着友机向敌人射击，它的子弹总能巧妙的避开同伙，击中敌人。尽管如此，面对这种大胆的做法，通讯回路里往往还是会响起同僚近乎于绝望的惨叫和类似于狂怒的谩骂，"勇，你这小子！回去后，我一定要亲手宰了你！"驾驶员对抗议充耳不闻，继续着自己的演出，所过之处，敌军和友军都乱作一团。
在将军的办公室里，勇遭到了严历的训斥，将军决定将这个屡教不改的飞行员调离部队，"疯子是不能留在战场上的，去做试飞员吧，那才是适合疯子的工作。""什么，要我去当试飞员？太谢谢你了舰长，我这就去报道。"红发的年青人竟然出乎意料的
感激，望着他兴奋的背影，舰长惊愕得一句话也说不出。
行星伊甸，是最早的移民星球，也是勇的故乡，自从2013年它被发现以来，数以亿计的移民来到这里开发建设。经过几十年的努力，拓荒者们依靠自己的双手建立起幸福的家园，伊甸也成为了殖民地中的佼佼者。沙漠中心座落着一个戒备森严的军事基地
，这里就是勇……F－11式服役的新机型，要求新机型性能上要比以前有较大的飞跃，甚至单机也可以进行超太空跳跃。通过投标，最后剩下的只有新星众工的YF－19和通用银河公司的YF－21，二者将在这里进行综合测试优胜者将获得项目，而勇就是YF－19的试飞员。门开了，一个身材魁梧的军人走了进来，青色的皮肤，绿色的头发，一看就知道具有天顶星人的血统。上校赶忙起身为两人介绍："中尉，这位是YF－21的试飞员，加鲁特这是勇戴逊中尉，他是刚刚来报道驾驶YF－1。"面对竞争对手，两人都是一愣。
测试工作是枯躁而紧张的，随时都会有生命危险，但勇的到来却使本来死气沉沉的基地，热闹起来。这个不守规矩的飞行员总是能带给大家意想不到的紧张状况，总是能在漫不经心中毁坏那些最精密的仪器，就拿他第一次上机来说吧，他以接近极限的速度回转，有时又突然关掉发动机令战机自由下落，所有的人都以为他在显示YF－19优异的性能，最后才发现他不过是想用航烟画一个翼手龙的涂鸦。这一系列疯狂的举动上校看在眼里却并不加以阻止，在他看来越是这样越能将机体的性能挖掘出来，既然连飞行员自己都不要命，自己又何必多事呢。将军的话不错，试飞员确实是适合疯子的工作。与勇形成鲜明的对比，加鲁特平日里少言寡语，行事稳重，与一般的飞机不同YF－21是采用最先进的脑控技术驱动，通过感应头盔将驾驶员的头部与飞机的操作系统相连，机翼由感受电磁波的记忆金属制成的，在允许范围内可以随驾驶员的意识而自由变形。当驾驶员坐上驾驶席后，他就与机体合为一体，必须杜绝杂念，全神贯注的飞行，也许是这个缘故，加鲁特经常被突发性的头痛困扰，有时还伴随有脑波紊乱的症状，但只有他自己清楚，造成这一切的是7年前的那件往事，罪魁祸首就是现在的竞争对手勇。
望着窗外的景色，美薇在逐渐理清思绪，7年了， 旧地重游的她比起当初已经成熟了许多，当年离开时还是个不谙世事一心要当大明星的小女孩，现如今做为莎朗……
摩托车的车灯照在两人的身上，坐在车上的是勇，他是带着机组的女同事露西出来兜风的，谁知会撞上这一幕，当勇看到美薇，他先是一愣，随即用嘲讽的口吻说："啊，这不是学园节的名星美薇小姐吗？什么时候成了加鲁特的女人？""你这小子！"加鲁特一把将他揪起来，"干吗，想打架吗？按老规矩！"，"住手！"美薇挡在两人之间，"七年了，为什么你们一点都没有变，住手吧，我已不是从前的我了，不值得你们这样做。"美薇哭着跑远了，加鲁特郑重的告诉勇："美薇和计划，我一样也不会让给你。"
几天后，勇、露西和YF－19的工程师杨诺文一道听了一场莎朗的音乐会，现场的气氛果然不同凡响，在音乐声中，莎朗的幻像忽隐忽现，行走在会场的各个角落，而莎朗似乎对勇特别感兴趣，在他身边转了好久才离去，当别人羡慕的望着勇时，坐在旁边的杨趁机用自己的"小发明"偷取了莎朗的感情程式。作为科研人员，再没有什么比人工智能更能吸引这位年轻的科学家了。而勇则陷入了迷惑之中，对这个幻觉的产物莎朗他并没有什么兴趣，但她的歌却有一种似曾相识的感觉，对了，有些像美薇的歌。
回到基地，杨发现萨朗的人工智能还远没有完成，而勇和加鲁特则接到了一段电话录音。录音说1个小时后， 演唱会现场将发生火情，美薇会遇到危险，勇认为是恶作剧没有加以理会，加鲁特则驾着车赶往现场。劳累的一天的美薇一个人在录音室里睡着了，醒来时发现自己被反锁在屋里，不知什么原因使电线短路，屋里起火了，美薇拼命的呼救，却没有人回答，浓烟中，加鲁特用肩膀撞开了房门，救出了美薇，萨朗的监视器在一旁默默的注视着两人离开。在加鲁特的寓所里，美薇苏醒过来，望着加鲁特身上的血迹，她不知道该说什么好，替加鲁特包扎好伤口，两人陷入良久的对视……
第二天早上，在基地的咖啡厅里，加鲁特告诉勇现在只剩下项目没分出胜负了。激愤之下，二人驾着战机在实验场上打了起来，不知为何枪里换上了实弹，勇的战机被击中，倒在了地上。
勇醒来时，发现自己躺在医院里，美薇正焦急的守候在床边，勇不愿像懦夫一样呆在床上，他带着美薇偷偷跑了出去。在树林里，两人回忆起小时候的往事："那时候，勇你骗我说水塘边有翼手龙的蛋，结果原来是三眼蛇的巢穴，幸好加鲁特带了枪……"美薇发觉失了言。两人在不经意间一直在回避加鲁特这个名字，但勇却并不在意，"是啊，聪明人就会带着枪，鲁莽的笨蛋就不同了，周全的办事永远都会被别人喜欢啊。"一只巨大的翼手龙从头顶飞过，两人不禁看出了神，"哈，你看到了吗？好大的一只呀。"，勇丢下美薇径自向前跑去，努力想要追上那天上飞翔的巨兽，望着他的背影，美薇喃喃地说"一点儿都没有改变。"
晚上，两人返回医院，看到了等在门口的露西和杨，此外还有愤怒的加鲁特。大雨中两个男人你一拳我一拳的打了起来，又是美薇阻止了两人，"不要打了，你们总是像傻瓜一样，不顾一切。可是我已经不值得你们这样。"美薇哭了，她告诉两人所谓莎朗艾普根本不能自己思考，是靠着与自己脑部相连而唱歌的，莎朗的歌就是她的歌。回到房中，杨惊奇的发现，存储在自己电脑中的感情程式竟然自动完成了，显示器上密密麻麻的都是勇的名字。
美薇走了，为了庆祝第一次宇宙大战胜利30周年，在地球要举行盛大的典礼，莎朗要在会上演歌助兴。在航空港，加鲁特前来为美薇送行，他把自己的护身符给了美薇，"一个星期后，项目就要最后决定了，那时我就去地球上接你，很久以来，一直有一种感觉，我似乎就是为了保护你而生的。"飞船上美薇打开了护身符，里面传出一阵熟悉的歌声"第一个词语是梦想……"这是她童年时爱唱的那首歌，美薇再也抑制不住自己的感情，泪水夺眶而出??
坏消息传来，军方一直秘密研制的"鬼魂X9"无人战机已经试制成功，并将在30周年大会上做现场表演，而YF－19和YF－21则被宣布终止研究。深夜，勇偷偷潜入机库，意外的发现杨也在这里，两人决定驾机去地球当着领导人们的面将鬼魂击败，以此证实YF－19的机能，由于YF-19能够单机进入跳跃状态，普通的战机是无法进行追捕的，米乔命令加鲁特驾驶YF－21去追击。"把你以前偷吃的午餐还我！""把你7年前借的CD还我！"两人一边翻旧帐一边在地球上空展开了最后的对决。缠斗中，加鲁特终于回忆起7年前失去理智的是自己，而不是勇。自己在事后失去了记忆，恢复理智后看到的是衣冠不整的美薇，所以一直认为勇是罪魁祸首。而美薇又不想让自己知道是他，才离开两人。
此时，在庆典典礼上，发生了意想不到的事情，莎朗自我有了知觉，原来是疯狂的研究员的马捷背地里开发了人格程式。莎朗开始行动了，她利用超时空要塞的中央电脑侵入了城市的各个系统中，在莎朗的歌声中所有的人都被催眠了。莎朗想要建立一个自己的王国，她将美薇关在了主控室里，并告诉美薇，它是从美薇这里获得了情感，火灾等一系列的事情都是它为了学习人类的感情而安排的。莎朗说出了美薇一直藏在心底的话，"我虽然爱加鲁特，但我更爱的人是勇，因为我爱她，所以我要击落他。你不明白做为飞行员，勇最大的梦想就是能在枪林弹雨中穿梭，飞行在生死一瞬之间，我可以满足他，你却没有这个能力。"在莎朗的操纵下，鬼怪向两人发起了攻击，YF－19和YF－21根本无法与其抗衡。加鲁特让勇先去救美薇，通过莎朗的话他已经明白了美薇的心意，但他一点儿也不后悔，他要用自己的全部去保护美薇。"勇，我先走一步了，照顾好美薇。"YF－21调过头去与鬼魂撞在了一起。悲奋的勇直扑超时空要塞，他要完成与死去朋友的约定，这也是他与自己的约定。YF－19自上而下，向一颗流星贯穿了超时空要塞的中心电脑室，莎朗的影象消失了，城市陷入一片黑暗之中。
清晨，美薇醒来，阳光透过打碎的天窗照射进来，一架孤独的战机在城市上空盘旋，像是在迎接新一天的到来。那是勇的战机，美薇露出了微笑，唱起了那支在心底埋藏已久的歌。

如月伸太郎，因为居住在其电脑中的电脑少女Ene恶作剧而使键盘及鼠标故障，为了添购替代品而中止长达两年的自宅守备任务，与Ene一同出门，不巧在百货公司被卷入恐怖份子策划的事件。

另一方面，如月伸太郎的妹妹人气偶像如月桃也正处于逃避疯狂人群的窘境，碰巧遇上拥有遮蔽目光能力的目隐团团长木户蕾。因为自己吸引目光的能力而苦恼的如月桃，认为木户蕾有能力治疗自己的体质而加入目隐团。由于小樱茉莉的失手使如月桃的手机故障，木户使用能力协同几人前往百货公司，正巧遇上事件，然后如月伸太郎就加入了目隐团......

2006年，为配合NDS版（钻石、珍珠版）的上市，TV动画同步推出全新系列《神奇宝贝钻石&珍珠》（Pokémon Diamond & Pearl，简称DP）。对战开拓区篇结束后，小遥为了独自挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆，小刚也回家去了。小智则受到了小茂的激励，独自带着皮卡丘和偷渡的长尾怪手前往神奥地区挑战联盟。
新登场的女主角小光，其蓝本取自电玩NDS版。为了成为顶尖协调训练家，小光从家乡双叶镇来到了位于真砂镇的山梨研究所领取最初的神奇宝贝。而同一时间，小智也抵达神奥地区，并在那里和小刚再度会合。机缘巧合，小光救了被火箭队抓走的皮卡丘，三人就一同结伴旅行，展开了新的旅程。
《神奇宝贝珍珠&钻石》每周四在日本首播。台湾也由中视进行转播，网络上能够找到前105集的国语配音。

母亲要杀他,这个冲击让伊达京介觉醒潜在能力。在京介觉得失意时,岬真夜这个让人忍不住关怀的女子出现在他面前。两人关系越来越密切此时,迷的突变体军团「hospitaru」(ホスピタル)和巨大企业「桐原体」的战斗机器人军团突然向他们攻击,为的是京介的双胞胎妹妹 琉奈为了保护妹妹和她的分身京介使用变身能力奋战着......

昭和20年，太平洋战争刚刚落下帷幕。经历了惨烈战火的日本山河寥落，百废待兴。生活在最低层的人们凭借一双勤劳的双手艰难求生。废墟上的东京，小商贩们渐渐云集，靠着他们物美价廉的美食为贫穷的手工业者提供果腹之餐，而立食师的神话也就此拉开序幕。月见之银二（吉祥寺怪人 配音）最早登场，长发飘飘宛如仙人的老者在霸王餐界打出名堂。在此之后，狐炸肉饼之阿银（兵藤真子 饰）、汉堡之阿哲（川井宪次 饰）、牛肉盖浇饭之牛五郎（川井宪次 饰）等传奇立食师相继登场，为二战后的日本发展史做出了异样的注脚……
本片由动画导演押井守根据自己2004年出版的同名小说改编。

“AD. POLICE”系列的第二部OVA动画，分为三部分。
《FAINT VOICE》：故事发生在2034年，人类与亚人类“布马”共同生活在东京。为了取缔犯罪的布马，“AＤ. POLICE”内部特设了一个名为“BRANCH”的特务组织。在搜查暴走布马的住所时，BRANCH的搜查官“巴兹·库别斯”和他的亚人类搭档“金宝”发现了大量的可疑药物。这些神秘药物与布马的暴走有没有关联呢？
《DREAMER》：BRANCH的女性搜查官“麦克儿森”在调查女布马的连续破坏事件时，和超高级的布马娼妓“夏娃”相遇了。为了将自己在梦中一直看到红衣红帽的小女孩的影像传递给别人，夏娃像往常一样赶去见她的老客户们。谁想出现在她面前的正是那个红色的女孩……
《KNIGHTS OF A ROUNDTABLE》：BRANCH的部长“高桥”突然失踪了，但在此之前，他好象与某个政治巨头发生了争执。最后，巴兹发现了高桥的行踪，可就在他赶去时，东京的上空响起了一连串的爆炸声。事后，巴兹的大名竟被列入了爆炸事件重大怀疑者的名单，他和高桥一起被卷入了一场恐怖的阴谋……

马德拉斯（小林沙苗 配音），一位行迹诡异的杀手，活跃在卡萨索尼卡王国内战的战场之上。玛格丽特（桑岛法子 配音），一笔价值不菲的遗产的唯一继承人，从小打到都是养尊处优的大小姐。这两个表面上看来毫无关联的女子，其唯一的共同点就是都失去了记忆。而玛格丽特唯一记得的，只有“马德拉斯”这一个名字。
一本神秘的绘本将玛格丽特带往了卡萨索尼卡，而国际犯罪组织安纺亦盯上了玛格丽特，他们派出了特务卡罗莎（森川智之 配音）潜伏在玛格丽特身边。在卡萨索尼卡，马德拉斯和玛格丽特终于相遇了，她们决定共同寻找绘本的起源和隐藏在其中的秘密，与此同时，马德拉斯和她的指导老师潘尼莎（雪野五月 配音）一起，揭露了安纺贩卖军火，并且想要掀起世界大战的巨大阴谋。

在冰与海水覆盖之下的火星。人们建立了具有巨大潜水艇功能，可以缓缓移动的居住地，它被称之为“都市船”。另一方面，因火星水是重要的能源，地球政府将火星作为了水资源的据点。在这之后，牵连地球在内的银河大战爆发了。曾因战争需要一度发达的火星经济，在战后，受战乱影响和地球政府的压制，陷入了史无前例的不景气中。
人们的不满空前激化，各地的叛乱军蜂拥而起。独立运动真正的爆发开来了。同时不时袭击军队设施的海盗也增多起来。地球政府结集了火星方面军，开始了镇压独立运动者和海盗的斗争

来自异次元的种族MU占领了东京，并将城市隐藏在巨大的防护壁之后，他们欺骗在东京生活的人们他们已经成为世界上仅存的人类。在防护壁之外，名为“TERRA”的反MU组织声势渐渐壮大。某日，在同MU激烈交火之时，一位名为神名绫人（下野紘 配音）的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中，在这里，绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”，并且成为了它的驾驶者。
在神秘女子的紫东遥（久川绫 配音）的带领下，绫人来到了防护壁之外，加入了TERRA，并且在那里遇见了名为如月久远（桑岛法子 配音）的女子。MU组织对TERRA发起了进攻，当TERRA的存亡陷入危机之中时，绫人再一次驾驶着Rahxephon，成为了这个组织的救世主。

勇、卡尔德和谬是从小在伊甸行星一起长大的老朋友。勇与卡尔德以航空事业为职志，谬则希望成为歌手。然而，当三人在高中毕业时，因为一次不预期的意外，使得三人就此各分东西。而谬也为此放弃了成为歌手的理想，成为一个现实的商人。 2040年，为了替换雷霆式战斗机，统合军方展开了一项名为超新星的计划，开发新一代的可变型战斗机。是时，卡尔德以通用银河公司的试飞主任的身分，于伊甸行星上的新爱德华基地负责YF-21的测试工作。已是统合军中尉的勇也在此时调返故乡，以试飞员的身分加入超新星计划，为另一竞争团队试飞YF-19。而成为夏浓之苹果经纪人的谬，则是为了公司的造势活动而回到伊甸。在不预期的机缘中，三人终于又同时回到故乡。这样的重逢，挑起了他们心中尘封已久的心结。在新仇加旧恨下，勇与卡尔德两人在超新星计划中开始了激烈的互角。 同时，统合军也正在进行一项秘密计划——开发取代有人飞机的无人战斗机鬼魂X-9，并将于第一次宇宙大战胜利纪念日发表。这一阴影，正要降临在超新星计划与两位主角的身上。这一次，他们将为过去的矛盾作出最后的总决算..........

宇宙世纪0153年，这个时候地球联邦已经名存实亡，统治衰颓腐朽，宇宙殖民地纷纷脱离控制，地球圈成为诸多军阀逐鹿的场所；建立于Side 2的新兴国家赞斯卡尔帝国开始对地球的侵略，联邦军根本无法阻挡，只有民间军事组织“神圣军事同盟”还在坚持抵抗。出于一个完全偶然的机会，少年胡索·艾文成为神圣军事同盟的驾驶员，被赋予了最新锐的机体，V高达……

创圣纪0011年的地球，由于11年前的大异变，人类丧失了2/3的人口。
南极冰山溶化，1万2千年前灭亡的亚特兰蒂亚重现于世，拥有双翼的「堕天翅族」苏醒了。他们将生物机械兵器「神话兽」接连送入人类的都市，捕获人类，摄取生体能源「Purana」。
另一方面，人类决心反击，从海底遗迹发掘岀三台组合（hybrid）战斗机「Vector Machine」。这是1万2千年前，将堕天翅族逼入灭亡绝境的传说中的兵器。Vector Machine经过合体，「机械天使Aquarion」即将现身。
要启动Aquarion，需要能与机体的机械生命感应和共鸣，称为「Element」的人。这要求特别敏锐的五感和纯真的灵魂，因此十五岁左右的少年少女们被选为机师，集中起来。
而后，「机械天使Aquarion」合体的时刻终于到来…

讲述在长时间窝在家中的青年“如月伸太郎”的电脑中，住着一个名为“贵音”的少女，以及他们遇到由拥有超能力的人所组成的“目隐团”之后，所发生的一连串充满奇幻色彩的故事。

这是以日本神话为底蕴的故事，巫童布椎暗已是个16岁的冷俊少年，由于“弑父”，内心时常受罪恶感的煎熬，“滥好人”七地健生的几句话解救了他受缚的心灵，加上其姐宁子对他怀有的不伦感情纠葛，主人公曲折离奇的寻剑之旅和危机重重的前世交错进行，十分错综复杂。故事的内容则是发展在灵、巫觋、念、神剑等等的东西上，主角闇己就是巫觋，巫觋简单的解释起来就类似所谓的乩童，也就是可以让神 灵附体的人，拥有与神沟通的能力，而媒介就是神剑，七地就是铸造神剑的瓮智彦的后代，两人在出云这个地方相遇，后来为了寻找失踪的神剑而在一起，至此开始了一段友情、爱情、亲情、灵异的冒险及纠葛……

堂本瞬一（森久保祥太郎 配音）拥有着出色的运动天赋，并且有着一颗不服输的好胜之心，这样的他在运动领域里总是遥遥领先，从未尝过败绩。一次偶然中，在一场YOYO比赛里，堂本瞬一遇见了名为北条院（上田祐司 配音）的选手，北条院所展现出的高超的控球技巧让堂本瞬一折服，就这样，堂本瞬一一脚踏入了YOYO的世界之中。
为了参加日本YOYO大赛，堂本瞬一开始了艰苦的训练。这项运动让他结识了许多志同道合的好友，却也令他遇见了水平不相上下的宿敌刚志（远近孝一 配音）。最终，堂本瞬一凭借着过人的实力获得了进入决赛的资格，然而，就在这个节骨眼上，他的YOYO竟然坏了。

『鋼鉄ジーグ』から50年後の2025年。九州全域は50年前に発生した謎のゾーンに覆われたままになっていた。
その九州に近い下関にハニワ幻神（げんじん）が再び出現。草薙剣児は鋼鉄神ジーグのパイロットとなり、幼馴染の珠城つばきや親友の美角鏡らと共に新ビルドベースの下、妃魅禍率いる邪魔大王国に戦いを挑む。