《炎黄二帝》集中描写了五千年前，原始社会濒临瓦解，私有财产不断出现的历转折时期，中华民族在大动荡中逐步融合的曲折历程。再现了炎帝、黄帝以及蚩尤三大部落艰苦创业的悲壮史诗，讴歌了中华民族对世界文明作出的卓越贡献，塑造了中华始祖富有传奇色彩的生动形象。

故事发生在明朝永乐年间。锣鼓喧天，鼓乐齐鸣。武状元及第的牌匾被官差郑重其事摆在最显眼的位置，武状元（修正宇 饰）仪表堂堂，威风凛凛骑在高头大马上，浩浩荡荡回到了家乡。当朝四品官员周定喜笑颜开，因为不久前诸位年兄保媒，给周定的女儿周凤莲和武状元说亲。两家你情我愿，一拍即合。转眼变到了迎亲的日子，恰在此时，凤莲的弟弟周进宝高中新科文状元。在送亲时候，周进宝惊讶地发现武状元府的一名丫鬟竟然和跳河身亡的妻子王定云一模一样。这次经历让进宝落下心病。
未过多久，知晓缘由的凤莲主动帮弟弟和定云沟通，促成了人间另一桩的美事……

故事发生在河南省西部辛庄村。由于贫穷，黑墩（李忘雄 饰）27岁尚未娶亲成家。丁云鹤（于绍康 饰）是个退休的铁路工人，有一手种瓜的绝活，五十年代因为错说一句话被打成右派，如今平反后受邀到各地指导种西瓜。黑墩请他到辛庄做种瓜的技术顾问，丁云鹤来到辛庄后，不但指导大伙种瓜，也带来了全新的生活理念，黑墩靠种瓜致富娶上了媳妇。村支书张米贵（杨子纯 饰）刚开始反对大伙弃农种瓜，现在瓜农丰收后他又拒绝支付按合同给丁云鹤的大笔酬金，他开始给丁云鹤罗织莫须有的罪名，并利用大伙的小农意识克扣丁云鹤应得的报酬，还组织捉奸闹剧，诬陷他与女房东有奸情，丁云鹤愤怒地离开了这个失信的村庄......

1945年8月，日寇无条件投降。羊角大娘（丁一 饰）在回村的路上捡到一个弃婴，从包裹婴儿的衣服上看，这应是一个日本小孩，犹豫再三，她还是把他抱回了家。村里乡亲和家人处于对日寇的痛恨，坚决反对她收养这个敌国婴儿，但人性善良的羊角大娘最终留下了他，取名狗娃，当孙子养着。渐渐长大的狗娃善解人意，他把羊角大娘的哑巴儿子葫芦（尤勇 饰）视为父亲，不料葫芦在一次筑路事故中遇难，无奈之下狗娃被送给无儿无女的牛金川（祝士彬 饰）。再后来，日渐年迈的大娘为给女儿秀秀（李婷 饰）换回一笔出嫁的彩礼，把狗娃送给了清凉寺。二十年后，随国家佛教代表团出访的明镜法师（濮存新 饰）到达日本，大岛和子（栗原小卷 饰）从那根腰带上认出了眼前的明镜法师就是自已失散了几十年的儿子......