一、本目录收录1900年至2005年国内(包括香港、澳门、台湾地区)公开正式发表的明史论文和著作之中文目录(以及个别发表于国内书刊的西文目录)。除了对本室上世纪70年代所编《中国近八十年明史论著目录》(1900年-1978年)进行增补和重新分类外，本书重点是力求全面收集1979年至2005年的明史论著条目，以充分反映当前明史研究新趋势、新特点、新水平。
二、论文目录分总论、政治、军事、法律、经济、社会、民族、思想文化与教育、中外关系、宗教与信仰、科技、地理与环境、文学艺术、文献与档案文书、文物考古、人物、研究综述与资讯、书评等工8大类。各大类下设子目。子目下，根据主题词或核心内容作适当归类，再按论著发表年代排序。核心内容或主题词相同者，原则上不予分散。如论明代君主专制之文，均归入政治。通论中；张居正改革，归入政治。制度中；“一条鞭法”、盐茶马政，归入经济．财政与赋役类。有些篇目涉及多方面内容，横跨几个类别，一是归入主题词在先的类别，二是根据内容分放两个类目，查阅时两者互见。如商人见于社会．社会分层与社会群体，有些则见于经济．商业。郑成功与海外关系，归入中外关系类，其他论郑氏集团活动者都归入政治．南明类。
三、书目除专著、译著外，凡现代人校订、注释、标点的有关明代史籍，以及明史论文集，均收录；影印者，则不收。近百年中，重印并经过校订、标点、注释的文章．，亦做史料收录，影印者不录。著作按年代排序。

梁方仲先生的学生黄启臣先生将梁先生的著作重新整理，交由中华书局整体出版。文集之一、二、三，是将分别曾由中华书局、中州古籍出版社、广州人民出版社三家出版的论文集以及一些未刊稿重新编排，确定了三个主题，分别是：明代赋役制度、明清赋税与社会经济、中国社会经济史论，这样的处理较以前单纯以论文集命名的方式更显主题明确。两部名著：《明代粮长制度》、《中国历代户口、田地、田赋统计》收入文集之四、之五。将未刊之梁方仲先生《中国经济史讲义》和《读书札记》整理出来，分别列为文集之六、之七。对难以收入三个主题中的文章，归入之八杂稿中。梁集共八种。