《海日楼札丛(繁体竖排版)》分为《海日楼札丛》、《海日楼题跋》两大部分，其中《海日楼札丛》共分为八卷，大致可以分为五个部分，主要内容是作者的读书笔记，重点放在史、地和音训之学。《札丛》的第一部分是经学，主要讲述了鼎革、纳甲主月、夏道遵命、格人、六行、调人、边见等。第二部分讲的是历史和舆地，主要讲述了太史公、余吾水、军自当、大秦国、讹言、乌丸、六朝论治近古、回纥、新李、五卫等。第三部分是哲学、宗教和医学书中关于儒学的阐释内容虽然不多，但是都非常有见地。在佛学方面作者开始考证密宗萌芽在龙树之前等，都是前人在佛学研究领域中没有触及的问题，关于禅宗的部分，更是有着非常多的创见。《札丛》的最后一部分是书法。《海日楼题跋》共分三卷：第一部分是书籍板本，在这一部分中，作者具有自己的见解，订正前人的误说，探索某些本子的本来面目。第二部分是碑帖，在这一部分中，融会各篇，可以系统地成为沈氏研究碑帖的一家之笔。第三部分是书画真迹，在这一部分中颇见作者对古典艺术的欣赏。《海日楼札丛(繁体竖排版)》充分的再现了沈曾植先生的学问的全貌以及传统学术历久弥新的美丽，是广大文化史感爱好者的理想选择。

孙诒让的二十余种著作，以《周礼正义》、《墨子间诂》、《札迻》、《古籀拾遗》、《契文举例》、《名原》、《温州经籍志》、《籀庼述林》尤负盛名。
札迻十二卷，是孙诒让第一部问世之作，成于清光绪十九年（一八九三年）。全书校勘订正了秦、汉至齐、梁间七十八种古书中的讹误衍脱千余条，是他三十多年研读古书心得的集录。“凡所考论，虽复简丝数米，或涉琐屑，于作述闳恉，未窥百一，然匡违芮佚，必有谊据，无以孤证肊说，贸乱古书之直”，是他遵循的基本原则。俞樾曾给以高度评价，说他“精孰训诂，通达假借，援据古籍以补正讹夺，根柢参考，而且对了解清代朴学及其研究方法，提高研读和整理古书的能力，亦可得到有益的启示。
《札迻》一书，系孙诒让把自己三十年来阅读周秦汉魏以迄齐梁的七十八种古籍所作的笔记，与他家见解互相参证，害以校勘文字，诠释疑义，订正讹误的校雠学名著。其考释精审，学者交誉。
卷一
易干凿度郑康成注
易干览图郑康成注
易辨终备郑康成注
易通卦验郑康成注
易是类谋某氏注
易坤灵图郑康成注
易干元序制记郑康成注
卷二
韩诗外传
春秋繁露
春秋释例
急就篇颜师古注
方言郭璞注
释名
卷三
战国策高诱注
越绝书
吴越春秋
汉旧仪
列女传
山海经郭璞注
山海经图赞
水经郦道元注
卷四
管子尹知章注
晏子春秋
老子王弼河上公注
文子徐灵府注
卷五
邓析子
列子张湛注
附校列子卢重元注
商子
庄子郭象注
卷六
卷七
卷八
卷九
卷十
卷十一
卷十二
附录

东汉王充的《论衡》，不仅是中国思想史上，也是世界思想史上的一部巨著。本书以文献学、考据学等传统研究方法与阐释学、接受理论、比较文学、原始思维理论等现代研究方法相结合，在关于《论衡》的成书时间和过程、《论衡》篇目排列的内在联系、《论衡》颂汉诸篇的写作动因、《论衡》与王充其他各书的关系、《论衡》的早期流传影响史、《论衡》的评论史、《论衡》的思想和文论等各个方面都取得了突破性进展，以实事求是的新说廓清了长期笼罩于《论衡》的各种偏见和迷雾。 本书的韩国版(繁体字版)出版于1995年，国内版(简体字版)则始终没有出过。这次由作者精心修订后出版，以供海内外研究者参考。