本片以“儿子”铁头的视角，追忆了1953年至1967年大陆几次政治运动中的三位父亲（爸爸、叔叔和继父）及母亲陈树娟（吕丽萍）的形象。有关“爸爸”林少龙（濮存昕）的最初回忆美好单纯，可是在他于反右派斗争中被划为右派后，一切都变了样，母亲在焦急等待中，等来他被一棵倒下来的大树压死的消息；随后，爸爸的好友李国栋（李雪健）李叔叔走进铁头与母亲的生活，“叔叔”是很好的人，可是在大跃进后期的大荒中，也因积劳成疾死去；紧接，母亲的第三任丈夫老干部（郭宝昌）成了铁头的“继父”，一开始铁头对他没有任何好感，就在两人握手言和之际，“继父”在文革中被造反派批斗致死，母亲也被划成反革命分子。

本片为日本80年代《豚鼠系列地下实验电影》的开篇之作。
故事讲述了三个男人绑架一个女人进行残忍的人体实验，目的是想要了解“人类所能承受的痛苦极限”，项目包括：殴，对女人进行残忍地殴打；蹴，用脚不断踢她身上的柔弱部位；抓，用金属钳子夹皮肤；回，将其灌醉后绑在椅子上进行疯狂旋转；音，将放着高分贝的尖利刺耳的噪音耳机强行戴在她头上长达几十个小时之久；剥，用钳子将其指甲剥下；烧，用热油泼在她的伤口上；虫，将蛆虫洒在已经腐烂的伤口上和身体上；脏，将血淋淋的动物内脏扔在她身上直至全身都被淹没；针，使用锋利的针从眼角穿透眼球……

日本的下水道里乌烟瘴气，有死婴，有恶心的气味和物体。里面竟然住着一条美人鱼（染井真理 饰）。 附近有一个画家（齐木茂 Shigeru Saiki 饰），嗜好就是钻入下水道作画。这样的癖好来源于画家小时候目睹家乡的河流遭受污染变成肮脏的下水渠 。这天他发现了下水道里的美人鱼，她身体受了伤，于是被画家带回家里，养在浴缸里面。但是，美人鱼的病一天天恶化。她的身上布满了脓包和蛆虫，脓包不断破裂，长长的蛆虫从里面探出头来，蠢蠢蠕动，身体腐烂直到肠子和眼珠都掉出来。画家帮助她结束痛苦，为她除虫把她肢解，血溅了一地。

影片的女主角“圣女”是一个超级肥胖的女人，她试图成为“世界上最污秽”的人。她可以把在肉店偷来的肉塞进阴道，也可以把地上的狗屎放进嘴里吃掉。影片另外的主角是更加变态的马波尔夫妇，他们专门强迫被绑架的妇女受孕，再将刚出生的孩子贩卖挣钱。“圣女”跟这对夫妇展开了激烈的暴力冲突，最后“圣女”解放了那些被关押的妇女，并枪决了他们。影片中，随处可见人工受精、拉屎吃大便（演员所吃的大便是真实的）、鸡奸等一系列赤裸裸的镜头，所以，小心你的心脏和胃。
《粉红色的火烈鸟》号称有史以来最淫秽最恶心的电影，如果你口味太轻，请慎重。