1988年7月，关东地区使用新型炸弹进行爆破，第三次世界大战即刻爆发。31年后，人类从一片废墟中重建都市，东京湾上建立了巨大城市——新东京。世界仿佛要恢复到以前的繁荣。
　　2019年的一个夜晚，新东京郊外的封闭高速公路上，暴走族团体正在公路上飙车。带头的少年，是一名叫做金田的职业高中学生。
　　突然，街上出现了一位奇怪的矮个子男子，暴走族少年铁雄为躲避车祸连人带车飞出公路。正当金田要拿那位男子问罪之时，军队驾驶直升飞机赶到，将那位矮个男子与铁雄一起收押。
　　铁雄进入了一个陌生的地方，这里似乎在从事超能力的研究。而金田则在盘算如何营救铁雄。二人都不知道，他们的未来，因为神秘力量——阿基拉而已经开始了巨大的变化。

猫姐姐病重卧床，灵魂正被死神带走。猫猫弟弟拼命与死神争回姐姐的灵魂，千辛万苦却只争回一半，姐姐虽然死而复生，可是睁开眼睛的姐姐却变得痴痴傻傻。猫猫姐弟原本受妈妈所托到街市买豆腐，但他们却辗转踏上为姐姐寻找另一半灵魂的旅程。
诡异的旅途中，不乏血腥与暴力，但也少不了温馨和生趣。他们遇上马戏团神奇的魔术师，穿过大海，走过沙漠，遇上大屋的奇怪主人，还遇上把猫猫残肢缝合的妇人，还有孩子脾气的上帝，随意拨弄着时间。最后他们终于找到了拯救姐姐的四叶花。