卡勒姆·林奇（迈克尔·法斯宾德 饰）在死刑即将执行之前清醒过来，发现他被索菲娅（玛丽昂·歌迪亚 饰）选中，来参加一个能让人类摆脱暴力冲动的计划。虚拟现实机器Animus能让用户体验祖先的记忆，被绑在机器上之后，卡勒姆·林奇意识到他是生活在西班牙宗教法庭时期一位刺客阿圭拉的后裔，他们寻找的是可以控制自由意志的伊甸园苹果。索菲娅在父亲艾伦（杰瑞米·艾恩斯 饰）施加的压力下不情愿地操纵着卡勒姆·林奇回到过去寻找伊甸园苹果在现代世界的下落，威胁着他身体和心理的健康。但在杀手同行穆萨（迈克尔·威廉姆斯 饰）暗示了卡勒姆·林奇，提醒他艾伦有可能动机不纯之后，卡勒姆·林奇开始重新考虑他的行为和动机，而人类自由意志的命运也变得悬而未决……

这是一个人类和兽人共存，和谐相处，互不侵犯的世界。人类生活在艾泽拉斯大陆中，兽人则在德拉诺劳作繁衍。某日，邪恶的兽人古尔丹（吴彦祖 饰）出现了，它打开了黑暗之门，肆意屠戮手无寸铁的人类，将艾泽拉斯大陆变为了一片地狱的火海。与此同时，曾经与世无争的兽人们如今变得凶猛残暴，他们来到人类的领地，在这里烧杀抢掠，无恶不作。
杜隆坦（托比·凯贝尔 Toby Kebbell 饰）是霜狼氏族的酋长，他发现了古尔丹的野心和阴谋，于是带领着自己的部族千里迢迢来到了艾泽拉斯，在此处，人类领袖洛萨（崔维斯·费米尔 Travis Fimmel 饰）亦在寻找结束战争的两全之道。