《低俗小说》由“文森特和马沙的妻子”、“金表”、“邦妮的处境”三个故事以及影片首尾的序幕和尾声五个部分组成。看似独立的小故事里面，却又有环环相扣的人和事。
盗贼“小南瓜”和“小兔子”在早餐店里打劫，却遇上了天大的麻烦——黑社会成员朱尔斯（塞缪尔•杰克逊Samuel L. Jackson饰）和文森特（约翰•特拉沃尔塔John Travolta饰）在店内用餐，可谓天外有天。二人是否会放过两名小盗贼？
而文森特是黑社会大哥马沙•华莱士（文•瑞姆斯Ving Rhames饰）的手下，马沙下命令让他陪妻子一个晚上，明知如有雷池必死无疑，但面对马沙妻子美艳诱惑，文森特该怎么办。
文森特的故事还没完，拳击手布奇（布鲁斯•威利斯Bruce Willis饰）的出现将令他的人生从此改变。布奇有一块祖传金表，就是因为这块金表，他和马沙分享了一个耻辱的秘密。
故事环状结构，回到开端。朱尔斯在小盗贼面前诵读圣经，表示对杀人的厌倦和感悟。什么事件令他如此转变？“邦妮的处境”中就有答案。

东赤胜、朱仲、君孙泰是三个从小一起长大的好朋友，在混乱颠倒的年代里，三个少年混迹街头，穿梭于刀光剑影之中，依靠暴力闯荡江湖。长大后，三人一同拜入全罗道黑帮头目金勇息的门下。十年风雨路，他们对老大忠心耿耿，彼此间的兄弟情谊也愈加深厚。
某日，赤胜因刺杀某帮派头目而被判入狱七年，在监狱中他偶然见到原本以为早已死掉的孙泰，大喜过望。另一方面，金勇息并不在乎手下小弟的忠心，这个唯利是图的黑帮分子和赤胜刺杀的帮派头目媾和，由此获取对方迷幻药的经营权，而代价则是除掉赤胜，赤胜的父母也因此身亡。遭到背叛的赤胜和孙泰等狱中好友策划逃亡，而他也将宿命地面对自己的兄弟朱仲……

1991年，香港黑帮三合会会员刘健明（刘德华）听从老大韩琛（曾志伟）的吩咐，加入警察部队成为黑帮卧底，韩琛许诺刘健明会帮其在七年后晋升为见习督察。1992年，警察训练学校优秀学员陈永仁（梁朝伟）被上级要求深入到三合会做卧底，终极目标是成为韩琛身边的红人。2002年，两人都不负重望，也都身背重压，刘健明渐想成为一个真正的好人，陈永仁则盼着尽快回归警察身份。
重案组从陈永仁手中获悉一批毒品交易情报，锁紧目标人物韩琛，没料情报被刘健明泄出，双方行动均告失败。但此事将双方均有卧底的事实暴露，引发双方高层清除内鬼的决心。命运迥异又相似的刘健明和陈永仁开始在无间道的旅程中接受严峻考验。