这个靠海的小镇比平日还要来得平静。所有的居民都消失了，莫非有人将他们烧成灰了？他们的命运似乎是操纵在一群外来的暴徒手中，他们来到这地方，主要为了寻找他们速食店所卖的汉堡的材料─人肉。在最后一名镇民断气之前，外面的世界听到了一声凄厉的求救声，于是新成立的「调查防御公司」成 员─贝瑞、狄瑞克、法兰和欧奇─朝危险区出发，在该区展开地毯式的搜索。

1990 年，一艘巨大的飞船出现在地球上空，人们惶恐不安，却又分外好奇。经过一段时间紧张的等待，外星飞船始终没有动静。人类终于小心翼翼靠近它，强行走进舱内，结果发现了不计其数的外星人。他们形容丑陋，宛如虾子，而且健康状况极差，虚弱无力。原来这是一群来自外星的难民，他们最终被地球人接纳，并隔离在南非约翰内斯堡的一片区域内生活，此地名为“第九区”。经过长达 20 年的繁衍，外星难民的数量扩张至 180 万之多，且和周边人类的矛盾冲突不断，越来越多的人类呼吁将“大虾”赶出地球。MNU（列国同盟组织）经过磋商，决定将外星难民迁移到更为偏远的区域。MNU 外星事务部门的特工威库斯（Sharlto Copley 饰）专门负责搬迁工作。威库斯在动员过程中傲慢随意，与当地居民冲突频频。最终，他为自己的行为付出代价，外星人的神秘流体将其感染，威库斯慢慢变成了外星人的模样。此时威库斯才真正体会到了外星移民在地球上受到的不公待遇，他决定做些什么改变局面……