畅销书作家在出国的前一晚于家中被杀。凶手很快落网，对罪行供认不讳、但求速死，却对作案动机语焉不详。
他当真是罪犯？他究竟为何杀人？
在彻查被害人与凶手的过去之后，警官面对案情、手法均平淡无奇的事实，却感到如坠万丈深渊般无边的寒意……
作为一部手记体杰作，《恶意》多年来在票选中始终名列前茅，同时被评论界和众多读者视为东野圭吾的巅峰之作，与《白夜行》同享光辉与荣耀：环环相扣的侦破进展百转千回，将手记体叙事的无限可能发挥得淋漓尽致；对复杂人性抽丝剥茧的深刻描画，令人眼花缭乱、哑口无言。
更引人注目的，是《恶意》与《白夜行》恰似两生花，《白夜行》中的爱情极度炽烈，令人粉身碎骨；《恶意》中的怨恨则无比深沉，令人万劫不复。人性的两极就这样奇异地直击人心。

美苏冷战之际，被称为天才脑外科医生的天马贤三，在西德留学研习医术，因深受院长和同事的赏识前途无量。但在一次手术中，救了从东德流亡过来的双胞胎之一的小男孩后，因违背了院长的意愿而失势，但随后而来的双胞胎的失踪与医院内凶杀案却使得他重新成为著名脑外科医师，9年后，柏林墙倒塌，因为一场事故天马医师，遇到了当年拯救的双胞胎之一的约翰，但现在的他已经成为了怪物，天马医生悔恨之余决定不惜一切代价，杀掉他。于是天马走上了身负冤罪，追杀怪物的道路。

"名字被写在这个笔记本上的人会死"
死神琉可拥有这样的死神笔记本，却将它遗失在人间。天才高中生夜神月捡到这本笔记本，本以为是恶作剧的他，在笔记本上写下了电视中播放的罪犯的名字，确认了笔记本能力的真实性。厌倦腐朽世界的夜神月使用笔记本的力量，开始杀死犯罪者，以此希望建立一个没有犯罪的美好理想世界，而自己成为“新世界的神”。
连续罪犯死亡事件，吸引了全世界警察的目光，更吸引了世界第一名侦探L的注意，L能否将被崇拜者称为“基拉”的夜神月逮捕？
一本死神的笔记本，拉开了天才与天才之间卓越巅峰的头脑战争的序幕。本已对人间失去兴趣的琉可，在旁观惊心动魄的斗智过程中感叹“人类，真有趣。”