十八世纪，让-马普蒂斯特•格雷诺耶（本•韦肖 Ben Whishaw 饰）出生在巴黎最肮脏、最恶臭不堪的地方——鱼市场上。格雷诺耶天生对气味有着惊人的天赋：无论恶臭还芳香，他都一一记住，并能轻易分辨各种气味。
当他在孤儿院长到13岁的时候，被院长卖给了制皮匠。格雷诺耶在制皮铺过着犬马不如的生活。机缘巧合，格雷诺耶在香水巴尔蒂尼面前展露了其过人的天赋，进入了香水铺工作。但格雷诺耶并不仅仅满足于制作出世界上最芳香的香水，他梦想学得如何保存万物气味的方法。巴尔蒂尼告诉格雷诺耶香水的起源地在格拉斯，那里的人知道保存气味的方法。格雷诺耶拿着巴尔蒂尼的推荐信来到了格拉斯。
格雷诺耶爱上了青春少女的体香，为了把这种香味保存下来，格雷诺耶最终走上了杀手的道路。

美苏冷战之际，被称为天才脑外科医生的天马贤三，在西德留学研习医术，因深受院长和同事的赏识前途无量。但在一次手术中，救了从东德流亡过来的双胞胎之一的小男孩后，因违背了院长的意愿而失势，但随后而来的双胞胎的失踪与医院内凶杀案却使得他重新成为著名脑外科医师，9年后，柏林墙倒塌，因为一场事故天马医师，遇到了当年拯救的双胞胎之一的约翰，但现在的他已经成为了怪物，天马医生悔恨之余决定不惜一切代价，杀掉他。于是天马走上了身负冤罪，追杀怪物的道路。

《化身博士》故事主角杰基尔博士是个双重性格的人，表面上他学识渊博、德高望重，内心深处却潜伏着一种肆无忌惮的邪恶。后来他发明了一种化学药剂，只需吞一点，他就能随心所欲地变成另一个肉身——寻欢作乐、放纵自己的矮小丑陋的海德先生——他在外干尽坏事，回到家后，再服一剂药水，则又变成了受人尊敬的杰基尔博士。可是，那个矮小的恶人海德渐渐不满足于附属地位，他在逐渐强大，他要控制杰基尔博士整个人。杰基尔博士与海德展开了斗争。谁是最后的胜利者？