“正义”，将新世界切开。

将灵魂数值化的巨大监视网络·西比拉系统维持着人类治安的近未来。在不断改变的世界中，刑警们手持用于测定与犯罪有关的数值“犯罪系数”的枪支“支配者”，追捕着犯下罪行之前的“潜在犯”。

本作是于2012年播出的原创电视动画《PSYCHO-PASS 心理测量者》的第三期作品，是关于两位新人监视官的故事。慎导灼与炯·米哈伊尔·伊格纳托夫，成为厚生省公安局的刑警，在这个不断改变的世界中追寻着真实。

2116年に起きた東南アジア連合・SEAUnでの事件後、狡噛慎也は放浪の旅を続けていた。南アジアの小国で、狡噛は武装ゲリラに襲われている難民を乗せたバスを救う。その中には、テンジンと名乗るひとりの少女がいた。かたき討ちのために戦い方を学びたいと狡噛に懇願するテンジン。出口のない世界の縁辺で、復讐を望む少女と復讐を終えた男が見届ける、この世界の様相とは…。

常守朱が公安局刑事課一係に配属される前の2112年夏、沖縄。
国防軍第15統合任務部隊に所属する須郷徹平は、優秀なパイロットとして軍事作戦に参加していた。
三ヶ月後、無人の武装ドローンが東京・国防省を攻撃する事件が発生する。
事件調査のため、国防軍基地を訪れた刑事課一係執行官・征陸智己は、須郷とともに事件の真相に迫る。

2117年冬、公安局ビルに一台の暴走車両が突入する事件が発生。その運転手は青森にある潜在犯隔離施設〈サンクチュアリ〉の心理カウンセラー・夜坂泉だった。しかし取調べ直前に夜坂の即時送還が決定する。 監視官の霜月美佳は、執行官・宜野座伸元らとともに夜坂送還のため青森へ向かう。 そこで待っていたのは、〈偽りの楽園〉だった。

2112年新人监视官常守朱和执行官狡噛慎也与以前发生的恶性案件的幕后黑手槙岛圣护相遇。槙岛圣护动摇了维持和平的系统的根基，质疑正义的存在。最后，狡啮对他执行了自己的正义，从此消失无踪……
2116年，日本政府开始向战乱国输入“Sibyl系统”和无人驾驶机器人，企图让这个系统控制全世界。他们在处于内战状态的SEAUn(东南亚诸国)实验性地导入了Sibyl系统，令其治理下的水上都市“香巴拉弗洛特”短暂地得到了平稳和安定的生活。但是，SEAUn却向日本派出了恐怖分子。恐怖分子偷偷潜入香巴拉弗洛特，企图对中枢发动攻击。其中出现了某名男子的身影。刑事课一系的常守朱奉命前往香巴拉佛洛特进行调查。为这片新土地带来正义的真相。

监视官常守朱在得知西比尔系统的真相后，选择遵从系统，并依然信守人性与法律秩序。她率领新生的刑事课一系，每天与犯罪者对抗着。
然而，足以动摇系统的怪物正在他们面前悄悄潜伏着，而他们却对此一无所知——

这是一个人类内心活动均能够数值化的科技时代，同样能被量化的，还有每个人的“犯罪系数”，而原先的调查和侦破都被犯罪系数的检测所替代。维持治安逮捕罪犯的职责，当然落在了警察们的头上，但同时，这些惩奸除恶的执行官们，本身就是拥有着高犯罪系数的危险人物，因此，另一批专门监视他们的“监视官”应运而生。
作为一名执行官，狡噛慎也（关智一 配音）有着极强的业务能力，在同其监视官常守朱（花泽香菜 配音），同事征陆智己（有本钦隆 配音）、縢秀星（石田彰 配音）、六合冢弥生（伊藤静 配音）的合作下，制服了一个又一个险恶的犯罪分子。但是在执行任务的同时，慎也也对这套全靠数据说话的系统产生了怀疑。