故事发生在炎热尚未散尽的夏末，大楼的废墟在月光的映照下显得更加阴森，近日来，不断的有少女来到此地，从楼上纵身跃下，等待着她们的，只有冰冷的死亡。她们彼此之间互不相识，生活轨迹没有任何交集，亦没有自杀的动机，这令社会和警方陷入了巨大的困惑之中。唯一知道真相的，是一位名叫苍崎澄子（本田贵子 配音）的年轻女子，而她的真实身份，竟是最高位的人偶师。
两仪式（坂本真绫 配音）开始着手调查这一连串的自杀事件，这位表面看来平凡无奇的和服女子，实际上是拥有“直死之魔眼”的厉害角色，在她的眼中，万物都被刻上了“死线”，只要沿着线切割下去，就能轻易的将其破坏殆尽。为了追查事件的真相，两仪式来到了废墟大楼，在那里等待着她的，不仅仅是阴谋，还有悲剧的初始。

1998年9月，围绕巫条大厦发生了连续少女坠楼事件。媒体将其报道为无法解释的自杀事件，而有一个人，看出了事件背后的某种关联。
她是魔术师苍崎橙子，伽蓝堂事务所的所长。解决都市不可思议事件的伽蓝堂只有三位成员：苍崎橙子、黑桐干也、两仪式。拥有“直死之眼”的两仪式受橙子所托，前往巫条大厦调查。等待她的是意想不到的敌人，而对抗敌人的武器，只有那把一直在式手中的匕首。而远在伽蓝堂，黑桐似乎被巫条大厦的魔力控制，失去了知觉。
日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第一章电影版。