喜马拉雅山脚下，有一座孤零零的破败房子，一生受尽苦难的印度老法官就住在那里，退休之后他只想与爱犬安度晚年。然而他失去双亲的十六岁的外孙女赛伊突然闯入他死寂的生活。赛伊是个纯洁无暇的少女，痴情地爱上了自己的数学老师——尼泊尔青年基恩。基恩是一名贫穷的青年知识分子，最终卷入尼泊尔的动乱，与赛伊的恋情处在风雨飘摇中。法官还有一个厨子，厨子的儿子比居历尽艰辛来到纽约，成了一个非法移民，，在纽约的餐馆里打黑工，过着暗无天日的生活。比居最后决定返回祖国，但一踏上国土，他就重新陷入绝望的处境。

《微物之神》透过女性敏锐的心灵和孩童清澈的眼光，观察南印度一个小村庄的宗教、社会和历史，处处流露着深沉、古老的悲伤，但悲中却不见一滴眼泪，因为喀拉拉的女人和孩子早已流干了眼泪，生命中只剩下些许的苍凉，无可奈何的嘲谑、嘲笑沉溺在种姓阶级制度[黑暗之心]中妄自尊大的男人，但也嘲谑她们自己，因为除了自我嘲谑，她们实不在能做什么。这是一部让人欲哭无泪的小说。