怪獸出現率在世界上名列前茅的日本，經常遭到怪獸肆無忌憚的侵略，嚴重影響到全民的日常生活。
日比野卡夫卡曾經立志成為防衛隊員，如今卻是在怪獸專門清潔業工作。某天，卡夫卡經由某種神秘的生物，身體居然變身成怪獸，負責討伐怪獸的日本防衛隊都以代號稱之為「怪獸8號」。