东京大街上的一角，某栋高楼的顶层废弃小屋中。町屋翔太正在制作梦想中的火炬，而他的朋友绫瀬明日奈的父亲的尸体，出现在了这座大厦。警察的调查没有什么结果。但第2天一位白发少女给翔太送来了明日奈的父亲写给翔太的“死后文”——死去的人留给生者世界的信息。而送信来的少女，自称文歌。死后文的内容是什么？是对尘世的思念，还是对生者的嘱咐？一封封“死后文”，引出了一段段人间悲剧。而送信少女文歌，似乎也隐藏着不可告人的秘密。

由于童年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，沉默寡言，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正直开朗稳重可靠的枣恭介（绿川光 配音），四肢发达头脑简单的井之原真人（神奈延年 配音），成熟勇敢剑术一流的宫泽谦吾（织田优成 配音）四人出现在了绝望的理树面前。他们自称“Little Busters”，想要利用理树的力量来完成拯救世界的重任。
就这样，理树成为了LB中的一份子，整日奔波解决一些说来宏大但其实十分平凡的委托。在相处的过程中，本来行为举止十分怪异的同伴们渐渐的变得可爱起来，理树也逐渐敞开了紧闭的心门，找回了久违的快乐。他开始明白，只要有一颗开朗向上的心，这样的生活一定能够继续下去直到永远。