剧情紧接外传 Battlefield of Pacifist（和平主义者的战场），地球与殖民地的战斗于殖民后196年结束。除五飞外，希洛等四位高达驾驶员决心把高达送往太阳丢弃，然而统一的地球圈再次被人类的欲望所吞噬，战乱再一次燃起。巴顿财团利用前OZ统帅杜鲁斯之女作傀儡领袖成立军队，以新建之殖民地X18999为基地，同时胁持担任地球外交官的莉莉娜作人质，企图实行第二次流星作战。希洛等人进入殖民地化解危机并把高达取回作战。

故事舞台是在机动战士高达中的一年战争终结后七年。战争结束后一部份吉恩公国军事势力并未降伏继续在各地与地球联邦军发生军事冲突，因此地球联邦军内部强力主张追杀吉恩残余份子的激进排他势力泰坦斯（Titans）结成。由于泰坦斯对宇宙住民的强硬血腥镇压的手段，反势力奥干A.E.U.G.(台湾翻译为奥干，港译为奥古)结成。故事的开始于宇宙世纪0087年（U.C. 0087），前半主要围绕奥干和泰坦斯两派系的对抗，中段吉恩残余份子上阿克西斯(港译为阿古捷斯)登场，与奥干、泰坦斯角力周周旋，展开激战。

【内容介绍】
宇宙世纪0079年1月3日， 7时20分，吉翁公国向地球联邦政府宣战，以被外届称为“独眼巨人”的MS核心部队，在未遭遇算得上是妨害的妨害下，使用装备热核弹头的火箭炮，无差别地摧毁了各殖民地，此外，为了要屠杀殖民地内的全体居民，大量投入神经毒气“G3”。由宣战开始不到40小时的时间，三个区的居民，约28亿人死亡。同时，“殖民地坠落”计划开始实行……
故事从史称“一周战争”爆发的第二天，U．C．0079年1月4日拉开了帷幕。在负责新型武器开发的吉翁公国第603技术试验队中，参军三个月身为纯粹技术人员的23岁金发男主角奥利弗·梅（Oliver May）中尉，与总帅府特派到舰队中的25岁红发女主角莫妮可·凯迪拉克（Monique Cadillac）上尉相遇了……
【背景介绍】
作为《机动战士高达》系列史上首部3D作品，《机动战士高达 MS IGLOO 一年战争秘录》OVA三部曲一直让高达迷们津津乐道，其以吉翁军士兵的视点表现战争而展开的出色剧情和3D化表演让习惯了以联邦军作为主角和二维动画人物的高达迷们第一次发现，原来“一年战争”也是能以这种方式表现的。随着《一年战争秘录》三部曲的结束，官方又推出了此系列的第二部作品《机动战士高达 MS IGLOO 默示录0079》，依然延续了《一年战争秘录》中的吉翁军的视点。

经过短暂的和平后，贵族主义在宇宙殖民地的政治界和商界中抬头，当中罗那家族更组成一支私立军队“骨十字先鋒軍”。地球联邦军一直对宇宙民居采取观察态度，并没有加以理会。U.C.0123年，骨十字先鋒軍部队突袭Side 4各宇宙殖民地，与地球联邦军部队交战。地球联邦军的机动战士的性能不及骨十字先鋒軍的机动战士，战争处于一面倒的状态。宇宙殖民地FRONTIER IV的某间大学内正在进行选美比赛，正当裁判宣布谢西莉胜出时，一架被毁的机动战士掉下来，会场顿时陷入恐慌。主角西普克和他的朋友集合后前往战争博物馆避难，但他们眼见地球联邦军节节败退，于是决定驾驶的半毁的旧式机动战士，想逃往24号港口乘搭难民船……

故事发生在一年战争期间，正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为正属于敌对的两方，所以不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。

宇宙世纪0079年1月3日， 7时20分，吉翁公国向地球联邦政府宣战，以被外届称为“独眼巨人”的MS核心部队，在未遭遇算得上是妨害的妨害下，使用装备热核弹头的火箭炮，无差别地摧毁了各殖民地，此外，为了要屠杀殖民地内的全体居民，大量投入神经毒气“G3”。由宣战开始不到40小时的时间，三个区的居民，约28亿人死亡。同时，“殖民地坠落”计划开始实行……
故事从史称“一周战争”爆发的第二天，U．C．0079年1月4日拉开了帷幕。在负责新型武器开发的吉翁公国第603技术试验队中，参军三个月身为纯粹技术人员的23岁金发男主角奥利弗·梅（Oliver May）中尉，与总帅府特派到舰队中的25岁红发女主角莫妮可·凯迪拉克（Monique Cadillac）上尉相遇了……

U.C.（宇宙世纪）0079年，人类向宇宙发展并建立了多个巨大的卫星，让人类能够居住在宇宙中。卫星的居民们不堪忍受地球联邦政府对其剥削和压迫，遂宣布独立，更组建军队与地球联邦政府决一雌雄。在战争中双方先后开发了机动战士并投入战场。NEWTYPE少年阿姆罗·雷无意中驾驶上联邦军新开发的机动战士高达，卷入后来被称为“一年战争”的战斗中，并与其宿敌夏亚·阿兹纳布尔相遇。