少年迈克·卡尔·帕伯（克雷顿·怀特森Clayton Watson 配音）近一段时间甚为困扰，他梦见自己从楼顶坠，坠落的过程，它能感受耳边的风声和气流的流动，能看到天空一瞬而过的飞鸟，一切的一切都无比真实，令他不禁产生“梦是真实，现实是梦”疑惑。清晨醒来，他通过网络漫无目的地求助，渴望有人能解答他的问题。终于有人回复了他，让迈克对现实的虚幻性更多了几分不确定。太阳高升，迈克照常上课，他的手机铃声突然响起，即使关机后也照响不误。听筒里传来了尼奥（基努·李维斯 Keanu Reeves 配音）的声音，尼奥告诉他，那些人已经知道迈克了知了虚拟世界的实相，正从四面八方向迈克奔来……

一座古老的资本主义城市，天空晦暗阴霾，冰冷潮湿，大街小巷尽是让人绝望的气息，生活于此的人们仿佛行尸走肉，全然不知前进的未来与方向。在一座公寓内，私人侦探艾什（詹姆斯·阿诺德·泰勒James Arnold Taylor 配音）惆怅困顿，他的银行帐户已经空空如也，门厅寥落的他已经做好退出这一行的打算。正在此时，一通神秘电话打了进来，对方拟雇用艾什追查传奇黑客崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 配音）的踪迹。起出准备拒绝的艾什，看在巨额预付款的份上最终接受此案。
然而这并非一项简单的任务，此前已有三位侦探为此一死一疯一失踪，崔妮蒂的身份似乎关联一个天大的秘密，以及难以想象的危险……