UC.(宇宙世纪)0079年，人类已经在宇宙发展并建立了许多巨大的殖民卫星，让人类能够居住在宇宙中。位于SIDE3的吉翁公国不堪忍受地球联邦政府对其剥削和压迫，遂宣布独立并组建对地球联邦宣战。在战争中双方先后开发了机动战士并投入战场。NEWTYPE少年阿姆罗·雷无意中驾驶上联邦军新开发的RX-78-2高达，卷入后来被称为“一年战争”中，并与其宿敌夏亚·阿兹纳布尔相遇。故事即是以阿姆罗为中心，描述他跟着高达的母舰白色要塞，历经种种困难而成长的故事，还被认定为少见的“NewType”。不过第43话中阿姆罗能够跟怀特要塞中多位主要人物进行心灵感应，可以确定他们都是被阿姆罗引发起觉醒的NewType。
主角群并不是唯一参与这场世纪之战的人群，而且战斗也不限于主角所参与的战役，在后来的官方OVA和MSV等各种衍生作品中还有陆续补充的内容，并且收入官方的一年战争史中。本片的战斗并不见得完全是一般高达迷心中决定性的战役，或许更像主角群的心路历程和个人战斗记录。
本作品的主要故事是描写两个政治上对立组织的战争中，偶然但主动地成为军用机器人驾驶员的主角，以及他的同伴们，在战火中拼命求生的群像剧。不止主角方面，支援主角的人们以及与主角对立的吉恩公国军官士兵也有许多个性丰富的人物。本作品对于双方角色的细致描写使得作品的世界内容非常丰富，也产生了许多有思想深度的名场景与故事。
本作品中少年在地球与殖民地的战乱中，为阻止吉恩军对平民的无辜伤害，偶然中坐上联邦军的新锐的机动兵器“Mobile Suit”高达(高达) RX-78-2，跟着怀特要塞流转于地球与宇宙间的情节，也在日后许多续作中出现。包括《机动战士Z高达》中的卡缪·比丹，《机动战士高达 ZZ》中的捷多与《机动战士高达独角兽》中的巴纳吉。
之后还推出了三部剧场版动画《高达屹立在大地之上》，《哀战士》《相逢在宇宙》，此作无论人气，票房，收视都是高达系列中最高的。

20世纪末，一种被称为“B细胞”的物质被发现存在于生物体内，这种物质会直接侵入生物的DNA内部，使其产生异变。科学家们对这种奇妙的物质产生了极大的兴趣，为此进行了多次动物实验，并秘密地准备将B细胞用在人体上。高中生海堂佑司在不知不觉中成为了牺牲品，也因B细胞的活性化而被诊为不治之症，进入了精心安排下的冷冻睡眠。在这段时间内，由于动物体内的B细胞无法通过冷冻来抑制，使其发生了突变增殖引发了物种变化，兔子和小狗成为了巨大的虫状怪物 BLUE。它们在很短的时间内交配繁殖，并将人类当作了自己的食物。整个世界很快就被数量庞大的BLUE所占据，只有1千万左右被选出的人逃到了太空殖民地“第二地球”里，而剩下的人类却只能留在地面上被BLUE所蹂躏……
人类的手亲手造出了罪孽，人类的手再次将自己推向无尽的深渊，不是天灾，不是虫孽，只是人祸而已……