谁也没有想到，一起惨无人道的女童虐杀案件竟会让全日本上下陷入疯狂。遇害者的爷爷蜷川隆兴（山崎努 饰）是在经济领域执牛耳的大人物，这名悲痛至极的老人在发行量最大的报纸上刊登悬赏启示，凡能杀死嫌疑人清丸国秀（藤原龙也 饰）的人，将得到10亿日元的酬金。这则前所未有的启示很快发生了作用，担心自身安全的清丸在福冈县投案自首，但为了将其押送回东京送检，还将跋涉一千多公里的路程。此时此刻，日本国民已经相继化身为为了金钱不惜动武杀人的阿修罗。危急关头，SP铭苅一基（大泽隆夫 饰）、白岩笃子（松岛菜菜子 饰）、奥村武（岸谷五朗 饰）、神箸正贵（永山绚斗 饰）以及关谷贤示（伊武雅刀 饰）等五名精英承担了押送的任务。交杂着人性和法律的抗争，恶魔清丸和保护他的警察踏上漫长而凶险的旅途……
本片根据木内一裕的同名原作改编。

《仁医2》完结篇延续前篇剧情，历史依旧向着既定方向有条不紊的前行，更多耳熟能详的历史角色悉数登场。南方仁（大泽隆夫 饰）以大夫的身份在江户时代生存了下来，所开设的医馆仁友堂亦步入正轨。一天他得知橘咲（绫濑遥 饰）的母亲患了当时普遍的脚气病，由此决意制作并普及可治愈该病的点心。与此同时，坂本龙马（内野圣阳 饰）出现在仁面前请求帮助。仁随龙马来到京都救治胜海舟的师父佐久间象山，竟从苏醒的后者口中得知了惊人的往事……禁门之变后京都满目疮痍，原本留下救人的仁被新撰组带至萨摩藩救治西乡隆盛。此后，坂本龙马牵线西乡隆盛与长州藩，促成萨长同盟。
亲历着幕末日本局势的陡然巨变，仁对自己之于这个时代意义有了崭新的认识。在不远的未来，他将重新邂逅寻找新生活的野风（中谷美纪 饰），前篇中围绕在他们周身的谜团亦将逐一得到解答。

经营“森林动物诊疗所”的兽医所长矢岛幸次（大泽隆夫 饰）是个内向且有些木讷的人，他早年丧妻，多年来与女儿美铃（小林凉子 饰）相依为命。幸次大学时的女友律子（松雪泰子 饰）是个工作狂热的摄影师，同时也是一位单身妈妈。某天，律子即将赶赴国外工作，临行前将独子太一（深泽岚 饰）寄养在幸次家里。
幸次原本正为和律子的关系而困扰，太一的到来更让他无所适从。不久，太一从野外捡回一只小狐狸。幸次发现，这个小家伙竟然患有严重的残疾。他原本希望太一扔掉这只没有生存希望的狐狸，但固执的男孩想尽办法，一定要将小狐狸治好，送归大自然和它母亲的身边……