胡八一、王胖子和大金牙被村民编造的绣花鞋的故事所骗，前往陕西古蓝县。水路艰险，胡八一挺身让众人脱险。在招待所幸遇陈瞎子提醒，得以逃脱村民圈套。三人无意掉入“龙岭迷窟”遭蝙蝠袭击，发现身上长出红斑，决定在王大爷家修整，遇到同样来找红斑根源的shirley杨，并听闻了鹧鸪哨和了尘大师寻找雮尘珠的英勇故事。几人决心寻找雮尘珠，陈瞎子告诉他们“内藏眢”就在此地。村民故技重施，威胁胡八一等人寻找钱财，两拨人马前往洞穴，遭到蜘蛛袭击，被困暗阁，但大家齐心协力，化险为夷，最终进入了“棋盘”机关，众人协作，找到了龙骨天书，逃出洞穴，准备前往云南继续解密“红斑”。

故事发生在一个和我们的地球很相似的世界里，那里人们的灵魂变成灵神跟随自己。莉拉自幼（Dakota Blue Richards 饰）跟随身为约旦大学校长的叔叔一起生活，她热情、勇敢且富有正义心。一天科尔特夫人（nicole kidman 饰）要到北方去，希望莉拉能伴随身边。好奇的莉拉开心地答应。临行前叔叔交给她一个黄金罗盘，告诉她世界上只有一个人能读懂。莉拉从黄金罗盘中不仅能得到所问问题的答案，还了解到了自己的身世之谜。这一路上，科尔特夫人行为诡异，莉拉还发现在特尔特夫人的一份名单上赫然写着自己失踪朋友罗杰的名字！罗杰和其他孩子一样，被诱拐到极北之地成为科学试验品。莉拉找到时机逃跑出来，自己动身前去拯救罗杰……