进藤光是一个小学6年级学生。有一天，小光跑到爷爷家里寻宝，想赚些零用钱，没想到偶然翻出了一个旧棋盘，就在分接触棋盘的一瞬间，附身于棋盘之上的平安时代天才棋士——藤原佐为的灵魂进入了他的体内。佐为热爱围棋如同生命，小光受到他的熏陶，逐渐对围棋产生了兴趣。
在围棋班上，小光听说各地都有围棋会所，便赶紧跑去下棋。不料在棋场中结识了围棋名人天才少年塔矢亮，为了测试佐为的实力，小光贸然与塔矢亮对弈，结果小胜对手。他误认为佐为的棋力仅能赢过与自己同龄的孩子，对此十分不满，然而塔矢亮却大受打击，失意至极。数日后，塔矢亮再次向小光挑战，虽然他对小光藐视围棋的态度妒火中烧，无奈再次惨败于小光之手，塔矢亮连番受挫，内心更加苦闷，小光应明明邀请，参加了叶濑中学的校庆活动，在会场上他向围棋部的棋谱问答发起挑战，并由此结识了将棋部的加贺……

六年级的小学生进藤光（川上友子 配音）无意中翻出了爷爷家的旧棋盘。触碰棋盘的一瞬间也释放出了寄居在其上的平安时代棋士藤原佐为（千叶进步 配音）的灵魂。附身于小光体内的佐为视棋如命，小光在其软磨硬泡下开始下围棋，接触了一批厉害的棋士，其中不乏他的同龄人。小光开始对围棋产生兴趣并展现了他的天分，而佐为则成为了小光的秘密老师……
《棋魂》改变自堀田由美的同名作品，漫画由小畑健执笔，并由日本棋院的女棋士梅泽由香里担当监修。当年上映引起轰动后，引发了一股学习围棋的热潮，借由佐为的附身改变了主人公进藤光，讲述了其棋艺和心灵的成长，也在其中普及了围棋知识，意义深远。