旅行者奇诺（Kino）骑着她那会说话的摩托车汉密斯（Hermes）到各个国家旅行，在每个国家奇诺都只停留三天，在她体会了该国家人民的文化、风俗之后，她便离开并前往另一个国家……

　　--世界は美しくなんかない　そして それ故に 美しい--

　　--The World Is Not Beautiful,Therefore It Is--

　　--这个世界并不美丽，然而，又因此而美丽--

孤儿哈金（大后寿寿花 配音）从小被神父收养，没想到，表面上光鲜伪善的神职人员背地里却是个以虐待儿童为乐的禽兽。虽然生活在非人的待遇之下，但单纯的哈金从来都没有放弃过可以获得自由的梦想，没想到，这一天，她的梦想竟然成为了现实。当那个名为道子（真木阳子 配音）的美丽女人出现在她的面前时，当哈金坐上她那造型夸张的坐骑时，当身后的警察马不停蹄的追赶她们二人的时，哈金明白，从此以后，她的命运，将完完全全的由她自己来掌控。
就这样，哈金和道子踏上了逃亡与流浪的旅程。她们的终点在哪里？桀骜不驯的道子又究竟有着怎样的神秘过往？

人类制造出了机器人作为他们的帮手，但机器人却最终背叛了人类，夺走了地球的统治权。就在人们被逼的走投无路之时，一位名叫露娜（矢岛晶子 配音）的少女成为了他们最后的希望。邪恶的机器人统领布莱金（内海贤二 配音）感受到了露娜所带来的威胁，派出了强大的机器人杀手追杀露娜，卡夏（古谷彻 配音）就是其中之一。最终，露娜死在了卡夏的手上。
露娜死后，整个世界开始迅速的衰败，一晃眼数百年过去，无论是人类或是机器人，都早已经不复存在。就在此时，卡夏再度现身，只是此时的它已经失去了曾经的记忆，在黑暗和混沌之中只剩下迷惘。

《枪神》根据由内藤泰弘先生的漫画原作漫画版TRIGUN（トライガン）改编。
故事从梅丽鲁和米丽——两位自称来自贝露那堤保险协会的少女，缉拿“世纪大飓风”的线索开始。可当她们两人遇到这个“红色衣服，金色头发，耳边还有耳环”的法修史坦毕特之后，根本无法想象他就是“传说中使一 个城市一夜间完全毁灭的危险人物，最危险的通缉犯”。这个整天叫着“LOVE＆PEACE”，爱甜甜圈如命的温柔男人怎么可能就是罪大恶极的法修。之后的旅行中他们互相照顾，帮助和保护了不少有困难的人，共同度过了不少险情，成为了很好的朋友。一切的平和直到GUNG-HO-GUNS的出现，一切都发生了改变，法修甚至开了杀戒。这个“与以灭绝人类为己任”超级杀手集团GUNG-HO-GUNS到底和法修有什么关系？他们又将面临怎样的挑战？