2071年的万圣节前夕，火星上的大城市突然发生了令人惊叹的犯罪。高速公路上一辆油罐车爆炸了。事故发生现场的人们因不明原因病倒，死伤人数超过400人。这样大规模的杀人事件，似乎是不明来源的生物武器所为。为此，火星政府发布了3亿圆的赏金悬赏恐怖分子。目击事件的faye单独行动妄图独占赏金，艾德使用黑客技术找到线索，与Bebop号上的大家一起行动。四人一狗组合再次出动，但他们不知道，这3亿元的代价，是对抗前所未有的强大犯罪者。

《枪神》根据由内藤泰弘先生的漫画原作漫画版TRIGUN（トライガン）改编。
故事从梅丽鲁和米丽——两位自称来自贝露那堤保险协会的少女，缉拿“世纪大飓风”的线索开始。可当她们两人遇到这个“红色衣服，金色头发，耳边还有耳环”的法修史坦毕特之后，根本无法想象他就是“传说中使一 个城市一夜间完全毁灭的危险人物，最危险的通缉犯”。这个整天叫着“LOVE＆PEACE”，爱甜甜圈如命的温柔男人怎么可能就是罪大恶极的法修。之后的旅行中他们互相照顾，帮助和保护了不少有困难的人，共同度过了不少险情，成为了很好的朋友。一切的平和直到GUNG-HO-GUNS的出现，一切都发生了改变，法修甚至开了杀戒。这个“与以灭绝人类为己任”超级杀手集团GUNG-HO-GUNS到底和法修有什么关系？他们又将面临怎样的挑战？