自从七原秋也与中川典子从新世纪教育法（简称BR）中逃出，两年转眼就过去了。人类社会进入了恐怖主义时代！首都在反BR国家的恐怖分子的袭击下，化为一片废墟。政府当局认定凶犯为七原秋也，开始了对其国际通缉。 七原作为反BR组织“wild seven”的精神领袖，对所有成人发出 了宣战通告。成人为了剿灭七原，发起了一个新游戏——BR2。又一个高中班被军队绑架到荒岛，他们无一例外地被勒令换上军队制服，稍有不从下场就只有死亡！又一场血腥、残忍、惨无人道的大逃杀开始了！
本片为《大逃杀》的续集，导演深作欣二在开机伊始便病倒，不久病故，其后的拍摄工作由他的儿子深作健太担任。

为了培养出忠实效忠于成人、在逆境中坚忍不拔的青少年一代，日本政府出台《BR》法案。每年都从全国学校随机抽出一个班级的同学，前往荒岛进行生存极限挑战——老师发给学生地图、粮食和各式武器，令他们自相残杀，直到存活下来的最后一个，才能离开荒岛。接下来，残酷的游戏规则和令人绝望的生存条件，使班级里的年轻人开始了相互杀戮。善良或者凶残，主动出击或者被动防守， 同学们开始了各自的计划，人性的丑恶在血腥的死亡中暴露无遗。
大逃杀的游戏在荒岛上壮烈上演。究竟学生们的宿命如何，谁才是最后的存活者。