健吾（竹野内豊饰）是个普通的水族馆员工，他原本有个幸福和睦的小家庭，最近却为了妹妹玛利亚（北乃きい饰）罹患重病而愁眉不展。除了要支付巨额的治疗费用，若不能早日找到匹配的肝脏，妹妹便有生命危险。健吾的未婚妻美奈子（板谷由夏饰）因无法承受巨大压力而离开了他。
某日，健吾无意间救下一名欲轻生的女子，该女子名为梨沙（上戸彩饰），哥哥（稻垣吾郎饰）不务正业，拖欠高利贷巨款，梨沙只好去风尘场所工作为家里还贷，不堪重负的她已经丧失了对生活的信心。
情急之下，健吾突然萌生和梨沙假结婚，再让她移植肝脏救妹妹的念头……

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那个“樱木泉”回来了！
在樱木（上户彩 饰）调离特命搜查室半年之后，白石（中原丈雄 饰）追查了14年之久的“八王子事件”有了新的发展！新发的一起命案中，发现了与八王子事件一致的弹痕，以此为契机，4科的人马再次集结，向未解决事件发起了挑战！
樱木泉从4组调到八王子南署强行犯罪搜查科已经半年了。4科以室长长岛秀夫（北大路欣也 饰）为首，由冢本（宫迫博之 饰）、高峰（山口纱弥加 饰）、仓田（杉本哲太 饰）等人继续运作，深泽（丸山智也 饰）则调到了搜查一课杀人犯罪调查组作组长。
某天，八王子妇产医院的院长坂东良平和另一神秘男子因火灾死亡。杀害神秘男子的凶器被判定14年前白石追查的“八王子事件”中所使用的枪支。因此，深泽向4科提出了协助请求。由于搜查本部设立在了八王子南署，樱木也得以久违的和深泽以及4科的各位再会。具备了搜查能力的樱木却没能成为调查组的一员，反而被安排成了杂役。
樱木看了白石搜集来的八王子事件的相关资料后了解到，所谓“八王子事件”指的是，1997年在八王子的市营垃圾场内发现女性遗体的事件。被害者是非法滞留的中国女性陈一琳，尸检发现有摘除肾脏和出产的痕迹。此外，根据科搜研大森和竹林的分析，判定了神秘男性的身份——野泽诚二。
白石前往拜访认识陈一琳的青年山本基喜（柳下大 饰），樱木乘机尾随并擅自参与到了搜查中。结果发现，坂东曾经涉及器官买卖，并和厚生劳动大臣三原敦夫有所关联，另外野泽的女儿14年前在坂东的医院生过小孩。樱木作为高峰的助手，前往患有白血病的野泽的女儿入住的医院。向母亲秀子听取了口供，可是没有发现丝毫和器官买卖有关的线索。同时，冢本和仓田前去调查坂东医院的护士负责人畑山昭子，也没发现有力的情报……
就在樱木渐渐丧失参与调查的干劲儿的时候，受长岛和冢本的要求，再次整理事件相关资料。科搜研则从陈一琳和野泽的遗物中发现了关联点……

以2009年11月在日本真实成立的警视厅“特别搜查对策室”为舞台背景的故事借由该团队的新人樱木泉（上户彩 饰）之眼展开。
任职于特别搜查对策室的樱木泉是个热血又执着的好青年，颇具正义感的她无法放任不公平和悬而未决的事情发生。而对策室则是汇聚各类精英的地方，泉的直属上司长岛秀夫（北大路欣也 饰）就是警视厅响当当的人物之一。除了优秀的团队外，对策室还有最尖端的技术设备，像是利用DNA来鉴别凶手等。这样的对策室把视线放在了那些未决的事件之上，集中精力调查棘手事件，只为寻求真相，还被害者一个公道，这就是对策室的目标。紧张又刺激的故事就此展开……