从赌上校园存亡的对战中撃败大学生选拔队后，大洗女子学园战车道部的成员们终于迎来了平稳的冬日。但随着三年生的毕业、学生会改选、新执行部开始运转等事情，平和的大洗女子学园亦逐渐沸腾起来。而为了可顺利通过AO入试升读大学，小桃作为队长带领大洗战车道部参与冬季大会「无限轨道杯」，却没料到面对首战对手‧BC自由学园便已迎来苦战！难道美穗等人和小桃的未来到此为止了吗？胜利将降临哪一方？

运动万能、拥有正义感，在班上最受欢迎的美墨莎莎。成绩优秀，永远是班上的第一名，但其实有点天真的雪城乃香，两人同是就读菲诺奈学院女子中学部二年级的学生。某一天，莎莎和乃香各自遇见了不可思议的神奇生物美波和米波，他们由于故乡光之园遭到邪恶的攻击，因而逃到虹之园来。
然后，莎莎和乃香被美波和米波赋予神奇的力量，携手变身成光之美少女“Pretty Cure”。
性格和兴趣都完全相反的两个人将同心协力，和来自闇之领域的邪恶敌人展开战斗。

二战后的十数年，日本从战败的阴影中逐渐走出，进入了经济高度增长的时代。然而强硬的经济政策也导致失业率的不断攀升，各种反政府武装势力不断抬头，安定的社会治安荡然无存。为了应对这一难题，政府建立了拥有高度自主权的首都圈治安警察机构，通过精良的装备和果断的武力来打击以“党派”为首的反政府组织。随着经济不断发展，崇尚暴力的首都圈警察和“党派”逐渐遭到民众的厌弃和孤立。
在一次激烈血腥的交战中，隶属“党派”的少女阿川引爆炸弹自杀，目睹这一幕的首都圈警察成员伏一贵心灵受到前所未有的冲击。这一刻起，他的人生悄悄发生转变……
本片荣获2000年每日电影最佳动画片奖、1999年葡萄牙国际奇幻电影节最佳动画片奖和评委会奖。

东京大街上的一角，某栋高楼的顶层废弃小屋中。町屋翔太正在制作梦想中的火炬，而他的朋友绫瀬明日奈的父亲的尸体，出现在了这座大厦。警察的调查没有什么结果。但第2天一位白发少女给翔太送来了明日奈的父亲写给翔太的“死后文”——死去的人留给生者世界的信息。而送信来的少女，自称文歌。死后文的内容是什么？是对尘世的思念，还是对生者的嘱咐？一封封“死后文”，引出了一段段人间悲剧。而送信少女文歌，似乎也隐藏着不可告人的秘密。

高中生四月一日君寻（福山润 配音）有着令他十分困扰的灵异体质，他总是能在不知不觉的情况下吸引大量的灵体。一日，偶然中他踏进了一间魔法商店，遇见了美丽神秘的店主壹原郁子（大原沙耶香 配音）。郁子告诉他这是一件帮人达成愿望的商店，四月一日君寻遂许下了希望能解除特异体质的愿望，可是这愿望售价昂贵，四月一日君寻不得不在店里打工来付清欠款。此间，他结实了沉默寡言的白目鬼静（中井和哉 配音）、厄运缠身的九轩葵（伊藤静 配音），以及一只造型怪异的名叫魔可拿的宠物。
在打工的过程中，四月一日君寻接触了一系列与愿望有关的事件，他发现，这个世上有好的愿望，有坏的愿望，有单纯的愿望，却也有无论如何努力都无法达成的愿望。人性、命运、必然、偶然，这一切都在店主壹原郁子的掌控之中。

近未来，被世人称为“美杜莎”的后天性细胞硬化症候群（ACIS）泛滥全球，被感染者经过30~60的潜伏期后，在短短的12天内就会病发身亡。死时全身石化，其状恐怖。由于没有任何的特效药和对峙办法，人类世界陷入一片末日般的恐慌之中。就在此时，科学研发企业维纳斯门宣称可通过冷冻睡眠的办法为人类保留生命的希望，但是全球仅有160人有资格走入冷冻胶囊。女孩一色霞（花泽香菜 配音）幸运地成为160人中的一员，但是她也要被迫和相亲相爱的双胞胎姐妹生离死别。当小霞再次醒来时，发现维纳斯门总部情景怪异，接着一群奇怪生物袭击了这些人，最终只有极少数人侥幸活了下来。等待小霞的，将会是怎样残酷的命运……
本片根据岩原裕二的同名原著漫画改编。