中世纪，炼金术士们以巨大的代价从恶魔的手中得到了传说中的永生之酒，凡是喝下永生之酒的人们，正如它的名字那样，将会得到永远不会死亡的肉体。永生之酒带来了希望，却也引发了空前绝后的灾难，因为私欲和利益，与此酒相关的人士一个接着一个失去了踪迹。随着禁酒令的颁布，永生之酒的下落逐渐成为了谜题，然而数年过后，有关它重出江湖的消息再次被传得沸沸扬扬，在纽约的黑道中激起了涟漪。
身怀绝技的少年洛菲（吉野裕行 配音）、不老不死的炼金术士阿洛瓦（宫本充 配音）、个性莽撞大大咧咧的夫妻艾萨克（小野坂昌也 配音）和哈文特（青木静香 配音），这些身份从无交集的人们，也为了追寻永生之酒的下落而走到了一起。

六年级的小学生进藤光（川上友子 配音）无意中翻出了爷爷家的旧棋盘。触碰棋盘的一瞬间也释放出了寄居在其上的平安时代棋士藤原佐为（千叶进步 配音）的灵魂。附身于小光体内的佐为视棋如命，小光在其软磨硬泡下开始下围棋，接触了一批厉害的棋士，其中不乏他的同龄人。小光开始对围棋产生兴趣并展现了他的天分，而佐为则成为了小光的秘密老师……
《棋魂》改变自堀田由美的同名作品，漫画由小畑健执笔，并由日本棋院的女棋士梅泽由香里担当监修。当年上映引起轰动后，引发了一股学习围棋的热潮，借由佐为的附身改变了主人公进藤光，讲述了其棋艺和心灵的成长，也在其中普及了围棋知识，意义深远。

故事发生在一座名为堕天城的城市之中，它夹在天堂和地狱之间，是一座充满了危险和奇遇的城市。近日来，城市里出现了邪恶的恶灵，他们依靠袭击市民们为生，这令市民们人心惶惶人人自危。
Panty（小笠原亚里沙 配音）和Stocking（伊濑茉莉也 配音）本是两位天使，却因为他们桀骜不驯的作风而被逐出了天堂，来到了堕天城。在这里，姐妹两人遇见了名为Garterbelt（石井康嗣 配音）的神父，在这位拥有着神秘过去的神父的带领下，Panty和Stocking成为了恶灵狩猎者，通过狩猎恶灵得到天堂金币，当天堂金币积攒到了一定的数量之时，Panty和Stocking便可以借此重新返回天堂。就这样，两人在堕天城的日常就此拉开了序幕。