Thomas獲肥控制員派到藍山石礦場工作，發現陌生的小火車Luke躲在山上的洞穴，Luke告訴Thomas一個驚人秘密：原來他初到索多島那天因搶先上岸，竟使同行的黃色火車掉進海裡，凶多吉少！Luke害怕被逐出索多島，於是一直躲藏起來。為了助新朋友重獲自由，Thomas決定要查明這宗古怪事件…

这个夏天，火车头Spencer来到索多，由于自负的Spencer经常冷嘲热讽，激怒了其他火车头，Thomas便决定要与Spencer展开一场激烈、惊险的环岛赛。
在比赛中途，Thomas的刹车系统突然失灵！急速撞入了一个隐蔽的树丛，发现埋藏着古老火车头Hiro，他将自己的不幸遭遇向Thomas倾诉，于是Thomas决定帮Hiro重新修理，回复本来的英武外表。可恶的Spencer却处处破坏, 令Thomas的拯救危险重重。 在一众热心朋友的帮助下, Thomas终于令Hiro重新振作，但棋差一着，被Spencer发现了Hiro， 并向肥站长告密，而Hiro又可能陷入另一场危机，会被丢到废铁场….