超人气的系列动画片《刀剑乱舞-花丸-》大银幕出阵！！
有着大棵万叶樱的本丸，正处于白雪覆盖之际──。刀剑男士大和守安定和加州清光聊起往事。当时有把刀接到时之政府的指令，被派遣到他们这个本丸，自称为名刀山姥切的本歌，名叫“山姥切长义”。
山姥切长义对自己的仿作“山姥切国广”摆出挑衅的态度，山姥切国广对他的想法也很复杂。加州清光察觉他们俩的心结，一心想要帮助伙伴；大和守安定看出加州清光的坚强意志，于是向他提出一个建议。
另一方面，本丸突然接到来电，这次的特命是去调查“历史被改变，被放弃的世界”。出阵的目的地是幕府末期，文久三年的土佐。身为坂本龙马佩刀的陆奥守吉行担任队长，五名刀剑男士动身前往历史被改变的土佐。然而那处的街道景象，和陆奥守吉行所知道的土佐完全不同。一伙人和先行前往调查的肥前忠广和南海太郎朝尊会合，然后四处奔走，讨伐改变历史的主谋。

某個本丸，迎接夏日的到來。增加了新的刀劍男士，日子變得更加熱鬧之際，審神者向他們下達了新的指令。那就是「放假三天」！刀劍男士們感念於審神者用心的安排，他們決定拍下在假期中的樣子，整理成紀念相簿作為回禮。
上山？下海？……刀劍男士們想了好多在假期中想做的事。此時，大和守安定也想做一本相簿送給外出修行中的加州清光，他四處探望大家的假期，盡可能拍下所有夥伴的身影。
沒有花季就在樹下賞葉飲酒，用木材創作各種手工藝，刀劍男士盡情享受山林之趣。大和守安定將這些全都用相片記錄下來，然後髭切邀請他一起去打鬼。隔天，大和守安定到了海邊赴約。刀劍男士在此更是徜徉於只有海邊能玩的遊戲和海味佳餚。第一次過暑假，難忘的回憶一個個刻在心頭──。

载着贝鲁利等人的米加法乌纳追赶吉特团从维纳斯·格罗布出发。但是，地球圈的战况已经完全改变了。在大气层外对峙的Capital Armiy和Ameria军队、Dolet舰队在禁忌存在的Casheba Mikoshi附近反复发生更激烈的冲突。在那漩涡中，贝鲁利想要消除战争产生的悲剧和憎恨，知道人类危机的姐姐艾达将目光转向了新的时代。但是，随着资本阿米与吉特团共同战斗，由米加法乌纳带来的新战斗力增强的阿米利亚军队与德雷特舰队联手，使宇宙战舰沉没的惊人的莫比尔套装群将陆续投入战场。激化，吞噬无数人命的宙域。然后，各势力被地球的重力所吸引，最终决战进入大气层内。站在大地上的G-Self，现在正引导着贝鲁利走向漫长旅途的终点……