本作的主人公是在光中消失的宇航飞行员的儿子。当时的他还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。

但传说战士长大之后加入了地球和平联合组织TPC，最初他在宇宙发射中心工作，后进入SUPER GUTS（超级胜利队）的学员训练班。在一次模拟战争中一举击败了SUPER GUTS的王牌飞行员由美村良，然而此时他却遇到了宇宙球体“斯菲亚”，虽然他奋力战斗，却寡不敌众。此时他看见了神秘的光，突然成为了戴拿奥特曼的人间体。当他清醒过来时，已经莫名其妙地成为了SUPER GUTS的队员了，是由美村举荐了他。

在火星的一次战斗中，斯菲亚与岩石合体，变成了怪兽。传说英雄在和它战斗时，身陷险境，此时他的身体发出闪亮的光。这时，他变成了新的光之巨人，以强大的实力击败了达兰比尔。当他恢复回原来的样子时，他的脚边出现了神秘的变身器——闪光剑。

之后超级胜利队的绿川麻衣给这个新的奥特曼起名“戴拿奥特曼”，光之巨人的故事开始了。

电视采访小组在追踪偶像的宣传策略过程中，接连发生不可思议的事故，甚至出现了死伤者。于是，他们开始着手调查真相。而摄像机捕捉到的画面，竟然是幽灵的身影…

城市中出現了來歷不明的光病毒。SRC中的Eyes隊成員為要確認光源搜尋至鏑矢島，遇上了對怪獸充滿愛心的預備飛行員春野武藏。此時，光病毒入侵怪獸力特里亞斯體內，力失控，Eyes準備向力發動攻擊，武藏決要阻止，危急中，超人高斯終於回來。

今数亿年前的超古代,有着比现代社会更加发达的具有高度文明的人类,然而,极度繁荣的社会却遭到"宇宙聪明"的野蛮攻击。超古代人类及其文明也在转眼间灰飞烟灰……数亿年后的现代,堀品博士(考古科学家)一次偶然的机会,从超古代遗留下来的"情报传递"装置--记忆水晶板中得知:人类遭受毁灭之前,超古代人就已经制造出具有人类最强大力量的机器人(超星神),并将能驱动它的力量的超古代遗传因子分别遗传在对应十二星座的十二名格兰赛沙的战士中.地球危机再度降临,风族,火族等十二名格兰赛沙战士也相继觉醒了.无敌机器人(超星人)也正式启动......by:m.yakubd.cc

故事发生在近未来的日本，政府设立了一块拥有治外法权的特殊地区专门有安置穷凶极恶的罪犯。在这块地区中有一所名为“天堂学园”的中学，孤独的少女亚马尻菊之助是那里的学生，她失去了关于过去的一切记忆。有时，菊之助会在梦中看见父亲驮卫门、哥哥五卫门、直次郎和弟弟吉三，一家人幸福生活在一起。
管理天堂学园的是校长生首团十郎，学校里净是些不良学生，暴力横行。转校生小雪成了被众人欺凌的对象。拥有正义感的菊之助拼命保护她，在与不良学生开战时，她突然感到一阵剧烈的头痛。
无法无天的亚马尻一家一直是政府的敌人，一年前，他们遭到惨败。特别地带正是为了安置他们而设立的。为了压制菊之助等人的暴力冲动，他们的脑中被植入了电子装置，成了洗脑超音波研究的活体实验品，而主持这项研究的正是团十郎的女儿羽仁井薰子。
菊之助发现了自己的身世，想要和家人团聚。亚马尻一家对团十郎一家的大战拉开了序幕……