当朝六王爷（单立文 饰）勾连土番，意图不轨。陇北节度使截获六王爷通外密信一封，遭六王爷座下两大宠幸刺客之一的“火云邪神”映霞（林青霞 饰）追杀，节度使遇刺前将密信、虎符交托亲弟玄明（莫少聪 饰），玄明避难一杂技班中，班主莲容（吴君如 饰）癫狂泼辣，爱慕玄明却不见容，只得藏起虎符强留。
莲容之兄阿镇（巫刚 饰）身为相国护卫，武艺高强。火云邪神行刺相国却不敌玄明阿镇联手，火云邪神为取回密信遂乔装普通民女混入戏班，潜伏日久，被戏班内平和亲切的氛围打动，但六王爷与另一刺客映雪（叶全真 饰）的耐心已到达了极限……

白莲教徒接下满清大臣纳兰元述（甄子丹）所下的对付革命党人的命令后，在广州街头借“扶清灭洋”的口号大肆捣乱洋人的使馆、教堂等地盘，甚至连小学生也不放过，他们的举动令黄飞鸿（李连杰）、十三姨（关之琳）与梁宽（莫少聪）异常气愤。
在某个医学会议上，黄飞鸿与革命党领袖孙文（张铁林）一见如故，发现革命党人对救国更具远见时，他决定帮助革命党人逃过厄运。随后，他直捣白莲教总坛决胜九宫真人，揭开迷信假像，又因奋慨国运衰竭民智末开，不惜与纳兰元述决一死战。

晚清末年，大清帝国摇摇欲倒。面对外敌来袭，慈禧太后鼓励民间习武抗敌。李鸿章为了逢迎太后，办起“狮王争霸”大赛。消息传出，各大门派纷纷摩拳擦掌，暗中招兵买马。一时，京城门派冲突四起。黄飞鸿（李连杰 饰）上书李鸿章欲取消“狮王争霸”，无奈李鸿章没有理会。无奈之下，黄飞鸿只好亲自参加，阻止各门派的自相残杀。“狮王争霸”开锣当天，校场上尘土飞扬，各门派自造的形象各异、杀伤力极强的“狮子头”粉墨登场。黄飞鸿亲自率领鬼脚七等徒弟也赶到了……