机械化帝国是一个不重视生命的机械帝国，首领是机械神，以攻占星球并把其机械化为已任。而除了地球，包括月球在内，整个太阳系已被机械化了。
峰崎拳一，立花浩美和朝冈忍子春风校园六年级生。就在他们回校参加开业礼时，机械化帝国的第一机械王齿车王开始攻击地球。就在峰崎拳一等人快要受袭，守卫地球的艾度兰打开一个时空裂缝，三人回到六千四百万年前的世界。这时光之人艾度兰已经差不多耗尽所有能量，于是他把三只恐龙型机械交给他们。
这次保护地球对抗机械化帝国的重任，就落在春风校园六年二组身上了。
由于齿车王多次失败，失去机械神的信任，最后一战更被新机械王电气王所杀。电气王乘坐机械神所给予的黑色战神对抗哥修罗，强调力量的他，经常利用军事武器变成机械兽，在某次战役受重伤，与黑色战神同化，但最后也战死。
机械神派出的第三个机械王引擎王，矢志以寻找最强力量为己任。但最后一刻，因企图反叛机械神而连累自己的机械儿子乔他宝。亦因挡着自爆的机械城被哥修罗刺穿身体而壮烈牺牲。
由于机械城大爆炸，引出时空洞穴，令时序大变，地球变成机械化，所以众人回到过去。原来当初机械化帝国第一个派去地球的原子王在艾度兰的攻击下节节败退，在将被消灭的时候拾得乔他宝的头(被卷入时空洞)。因乔他宝的头收藏了哥修罗的大量资料，故原子王依照这些资料制造一部黑暗哥修罗，使艾度兰反胜为败。最后众人消灭原子王，使时序回复正常，同时他们也见证恐龙灭亡的定律。
机械神由于连续失去多个机械王，故以大量能量，使四大机械王复活，并给予他们无限能量，可以自由巨大化，被击败也可复活，也可以自由合体。但在他们多次失败之后，机械神把他们杀死，并亲自到达地球与哥修罗作最后决战。
学生们发明了反机械化装置，以哥修罗的能量把地球以及各被机械化的星球回复正常，使情势逆转，最后更一举消灭机械神，令机械化帝国被消灭。

毛查查（丘梅君 配音）出生在毛球星，他和弟弟毛啦啦（林丹凤 配音）、妹妹毛噜噜（沈小兰 配音）一起千里迢迢来到了地球，只为了寻找传说中的莫哈拉达摩佳宝藏。在地球，毛查查一行人偶然遇见了善良的空夫（蔡惠萍 配音）和美琪，毛查查更是成为了空夫家中的暂住客。
在空夫的帮助下，毛查查踏上了寻找宝藏的旅途，同样在寻找宝藏的，还有毛查查的旧相识毛毛查（谢洁贞 配音），毛毛查立志要在毛查查之前找到宝藏，因此两人之间的竞争十分激烈。在寻找宝藏的过程中，毛查查和空夫一起经历了磨难，遭受了考验，两人之间结下了深厚的友谊，那么他们最终能否顺利找到宝藏呢？

U.C. 0079年10月。到地球战线赴任的年轻联邦军官西罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为分属敌对两方而不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，西罗和他的第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。

真新镇的少年年满10岁之后，就可以得到训练神奇宝贝的资格。10岁的少年小智（松本梨香 配音）以成为最厉害的神奇宝贝训练大师为目标，即将踏上了修行之旅。小智因为早上赖床迟到，险些失去挑选神奇宝贝的资格，无奈下他领走了一只被挑剩下的神奇宝贝——皮卡丘（大谷育江 配音）。皮卡丘又名电气鼠，虽然长相可爱，但性格含羞内向却又不亲近人类，稍有不满就乱放电电人，暴躁的脾气让小智吃尽了苦头。大木博士把神奇宝贝图和宝贝球作为践行礼物送给了小智。在小智和皮卡丘的前方，神奇宝贝的世界有许多谜题和探险在等着他们，迎接他们的到底是光明还是黑暗，小智能否如愿成为神奇宝贝大师呢？

故事发生在遥远的月球之上，彼时，那里已经变成了适宜人类居住的星球。某日，来月球旅行的遥大地（松冈洋子 配音）邂逅了名为“兔人”的月球种族，他们告诉遥大地，他们位于月球内层的星球遭到了邪动族的侵略都和霸占，为此，他们踏上了寻找能够对抗邪动族的勇士的旅程。
让兔人们没有想到的是，遥大地竟然就是他们要找的光明魔动战士，通过魔法阵，遥大地召唤出了地之魔动王。之后，召唤出风之魔动王的山本加斯（松田辰也 配音），召唤出水之魔动王的玛利乌斯（安达忍 配音）等人纷纷登场，一行人来到了圣地路那，准备在那里展开一段惊心动魄的奇幻旅程。