1941年春，在莫斯科市中心，两个情报部门正展开着激烈对决。希特勒秘密行动小组的目的就是给斯大林提供德国进攻苏联的错误情报。国安政治委员奥克季亚布里斯基和中尉多林是法西斯间谍组织里面的天才。大历史环境下的战斗，马上就要开始了。

年轻女医生Tatiana Yurievna（奥莎娜·阿金什那 Oksana Akinshina 饰）因为使用具争议的技术而差点被吊销医师执照。但她被军方招募来到一个机密的研究机构，协助研究一个特别的案例，太空人Konstantin Sergeyevich（彼得·费奥多罗 夫 Pyotr Fyodorov 饰）。这位太空人历经神秘的太空意外后幸存返回地球，体内却多了外星生物，而且这个神秘生物只在深夜时现身。军方想拥有这个外星生物进行邪恶的计划，但女医生只想阻止外星生物杀害太空人。

《第九连》突破苏联共产时代的话语禁忌，以苏联入侵阿富汗事件为背景，电影的故事发生在1987-1989年，当时由于穆斯林的强烈抵抗，苏联在阿富汗损兵折将，近15000名苏联士兵伤亡，苏联特别成立了“第九突击队”协助前线战斗。6名来自西伯利亚的小伙子接受了严格的训练，1987年末这支奇兵被派往阿富汗海拔3234高地的战争中心以掩护苏联士兵撤退，迎接他们的，除了“第九突击队”的前辈，还有生死茫茫的战场。