宇宙世纪U.C. 0071年，离开SIDE 3慕佐自治共和国后的第3年。吉翁‧兹姆‧戴肯的遗孤卡斯巴尔跟阿尔黛西亚兄妹，与金巴‧拉尔一起逃往地球，并寄住在迪亚波罗‧玛斯家中，改名为爱德华·玛斯与塞拉·玛斯，开始过着平稳的日子。而一直追踪他们的扎比家的魔爪，悄悄地再次逼近…
此时，SIDE 3将国名更改为吉翁自治共和国。扎比家不但掌握实权，整个支配体制也日渐巩固，更开始着手开发对抗地球联邦军的最新兵器－机动战士。

【故事简介】
利翁兹·奥马克与天人的战斗以真正的改革者刹那·F·清英等人的胜利拉上了帷幕。独立治安维和部队A-Laws解体，世界终于走向了和平。这样过了两年，西历2314年，表面上消失了的天人为了防止战争发生仍然在暗处活动着，这时，新的战争打响了信号。再次集结起来的高达驾驶员们乘坐着新式高达，开始了战斗！
【STAFF】
企画：sunrise
原作：矢立肇、富野由悠季
脚本：黑田洋介
人设原案：高河弓
动画人设：千叶道德
机体设定： 海老川兼武、柳濑敬之、福地仁、鹫尾直广、寺冈贤司、中谷诚一、大河原邦男
动画机体设定： 中谷诚一
美术设定：须江信人（KUSANAGI）
美术监督：若松荣司（KUSANAGI）
色彩设计：手岛明美（Wish）
音响监督：三间雅文
摄影监督：葛山刚士（旭Production）
旁白：古谷彻
制作人：池谷浩臣（sunrise）、佐々木新（sunrise）
监督：水岛精二
制作：创通、sunrise

第二季1－13话再编集。

第二季14－25话再编集。

音无结弦（神谷浩史 配音）死后来到了死后的世界。醒来后发现在一座学校里，一名叫仲村由里（樱井浩美 配音）的女孩让他加入“无法容忍死掉战线”组织，简称 SSS。他们的任务就是要和敌人 —— 神的代表学生会长天使立华奏（花泽香菜 配音）作战。由里是这条战线的领袖，只要反抗天使就能继续存在，消灭天使就能获得世界。还没恢复记忆的音无只好答应加入她们的组织，但是他发现天使刀枪不入，他们都是不会受伤和死亡的。所谓敌人和战斗都是针对天使立华奏一个人的。音无还没恢复记忆，他不清楚这样的行为是不是正当的。真相慢慢被揭穿，年轻的生命们早早夭折，到底是神的恶意玩笑还是另有安排。

以军火商人的独特视角描述了一名少年佣兵在一名年轻女性所领导的军火贩卖集团中的日常生活、和他的所见所闻。
另外，展现了许多真实存在的武器资料，有时会加入现实世界的国际关系，是它的特色之一。