神崎瞳（坂本真绫 配音）出生在难能可贵的和平年代，然而，日复一日波澜不惊的生活却让她感到厌倦至极，甚至失去了生活下去的希望。在一场意外中，瞳被传送到了名为盖亚的异世界中，在这里，人们要抵抗的是来自强大黑龙族的破坏和攻击。而唯一能够拯救这个世界的，是名为梵（关智一 配音）的龙族后裔。 被传送到这个世界的瞳，见到了曾经在幻觉中出现过的龙之铠甲艾斯嘉科尼中，成为了人们眼中的救世主，背负上了拯救苍生的重任，而她和梵共同对抗的，竟然就是梵的哥哥。在激烈的交战中，瞳渐渐找回了活着的意义，而瞳的出现亦让一心求死的梵产生了活下去的勇气。

在远古天界，雷神帝释天发动叛乱，杀死了天帝并夺取王位，天帝的守护神阿修罗一族也被消灭。三百年的时间过去后，被帝释天囚禁的星见九曜逃出水牢，将背天“六星”的预言传达给夜叉王。夜叉王在指引下进入了封印之林，唤醒了封在森林中的小阿修罗，由此开启了“六星”的命运。 因夜叉王唤醒阿修罗，夜叉一族被帝释天派出毗沙门天以“背叛”的罪名屠杀殆尽。 于是最后的“夜叉”与最后的“阿修罗”踏上了寻找“六星”覆灭帝释天的旅程。 在旅途中，被帝释天迫害的苏摩、迦楼罗王和龙王与他们汇合，顺着修罗刀的指引，五人前往善见城追寻“六星”的最后一星乾达婆王并向帝释天发起最后的决战，由此掀开了最终的真相，上演了一个关于宿命、约定与破命的故事。

由优莱卡创建的珊瑚岩（类似珊瑚的信息生命形式）中的虚拟世界。自从虚拟世界的人民随着崩坏出现在这个地球上以来，十年已经过去了。因为这种“大融合”，虚拟世界中的人类称自己为“绿色地球”，旧地球上的人类自称为“蓝色地球”，各种碰撞将在水面下不断重复。绿色地球军的高级官员杜威·诺瓦克和他的同事一起策划，为保护他们的尊严，最终实施了一项大规模的恐怖主义计划。

2005年日本的冲绳，被宫城乔治收作养女的高中生音无小夜，每天过着平静的日子。她唯一所缺少的是一年多以前的记忆，而平静的生活也因神秘的吸血智慧生物“翼手”的出现开始改变。

而哈吉则是一位身着黑色的衣服，演奏大提琴的谜样青年。当他将一把与小夜命运与共的武士刀交给少女小夜之时，历史的车轮终于开始滚动。

故事以小夜和翼手之间的战斗以及追寻小夜的身世之谜为主线，讲诉了小夜等人在世界各国的冒险经历，大致可分成冲绳篇（1话-7话、14、15话）、越南篇（8话-13话）、俄罗斯篇（16话-19话）、法国篇（20话-32话）、英国篇（33话-40话）和美国篇（41话-最终话）六个部分。

Long ago, the gate to the world of darkness was sealed. Now evil warriors, known as Remnants, are trying to reopen the gate and let demons take over the world. However, at Tobira High School, there exist guardians of the gate who must risk their lives to prevent the gate from being opened.