在网路上，突然出现了一隻数码蛋，这隻蛋破壳后，出生了一隻数码宝贝，它疯狂地吞噬着整个电力网络系统，给电力网络运行造成了重大影响，而且它不断地进化，食量也越来越大。太一在开始的时候和素娜吵架了，阿和和阿武外出了，美美去玩了，阿助……只有光子郎和太一在，阿武和阿和找到了电脑来支援太一，后来那个数码宝贝又一次进化了！这时候，发生了一件意想不到的事情……

仓田纱南（小田静枝 配音）从小就进入剧团表演，以童星的身份出道，人气十分了得。可是，即使是这样的孩子也有着数不清的烦恼。班上名为羽山秋人（中崎达也 配音）的男生带头反抗老师，使得班级陷入混乱之中，令纱南十分头痛，然而，当纱南得知秋人悲惨的身世和糟糕的家庭状况之后，决心依靠自己的力量来治愈秋人。
佐佐木刚（三泽真弓 配音）是纱南和秋人的朋友，善良的刚不幸遭遇了家庭破裂的悲剧而遭到同学们的嘲笑，就在此时，善良的杉田亚矢（菊地晶子 配音）站了出来，不仅袒护了刚，跟做出了惊人的告白。在不知不觉中，纱南已经深深喜欢上了秋人，然而，当她意识到自己的感情之时，却得知秋人已经开始了和好友松井风花（生驹治美 配音）的交往。

三年前在网络世界被奥米加兽打败的超恶魔兽重生，并不断地产生自己的婴儿期，婴儿期的超恶魔兽通过手机、电脑等入侵现实世界，在现实世界形成数码蛋，最后超恶魔兽出现在现实世界，连最强的奥米加兽被打败。。。。

自从艾力欧走后，友枝町又恢复了宁静。无法目睹到小樱（丹下樱 配音）收复卡片英姿的知世（岩男润子 配音）找来了DV，自己弄起了特摄剧。在看录像带的过程中，小樱看到了小狼（熊井素子 配音）的影像，不经红了脸。小狼回到香港已经四个月了，距离小狼告白也有四个月了。这期间小樱一直模拟着告白，希望下次再见到小狼时，当面告诉他。
艾利欧的家被拆了后，建起了游乐园。某次小樱和知世经过时，小樱发觉了不一样的气息，追随着跑进游乐园，结果撞上了一个人，抬头一看发现竟然是小狼。原来小狼和莓玲趁暑假来日本玩。再次和小狼相见，让小樱非常紧张也在寻找表达心意的机会，但无奈都被阴差阳错的打乱。而这时，小樱发现自己的牌变少了，而牌走失的方向正是游乐园。传说中被封印的最后一张卡片，艰难的战斗，小樱能否胜利？而她是否又能向小狼成功传达心意呢？

木之本樱，是擅长体育的小学4年级学生。某天，小樱从学校回家，在平常都没有人的地下书房发现似乎有什么人的样子。小樱走下去一看，那里有一本闪耀着金色光芒的书。里面装有牌，然而，在读写在上面的文字的时候，刮来了剧烈的风，牌四处飞散开去。从书的最后，出现了名为可鲁贝洛斯的奇妙生物，书中写着“库洛牌的封印被解开之时，灾难就会降临世间”之类的话。随后，可鲁贝洛斯将封印的钥匙交给了小樱，令她成为收复牌的魔卡捕获者。当晚，小樱用魔法与实体化的魔卡对决……