江户时期，幕府与山阴的因幡藩之间的斗争隐秘而残酷。因幡藩为了对幕府掩盖自己的罪行，派人杀害幕府的剑术老师并嫁祸给自己的藩士香川。嫁祸之后，藩内还派出众多藩士追击香川，准备杀人灭口。但香川武艺高强，在反击中消灭了众多藩士，最终与自己亦师亦友的原田展开生死对决。

幼き頃、父に徹底的に鍛えられた武蔵。二十一歳、剣術の名門、吉岡家に挑むため、京に来た。当主、吉岡清十郎との試合のつもりが、弟の伝七郎、そして、一門数十名との一乗寺下がり松での決闘と熾烈な戦いを繰りひろげることになる。
その頃、細川家の重臣、沢村大学は、京の愛宕山で佐々木小次郎と出会う。武蔵は鎖鎌の宍戸、槍の道栄とも戦う。そして、ついには、細川家の剣術指南となった小次郎と雌雄を決することとなる。