故事背景为日本的江户时代，风是一家小茶馆的侍女，这天茶馆里来了一群地方恶霸，其中地方官儿子龙次郎尤其欺人太甚。风因为意外得罪了龙次郎，情急之下，茶馆内一名无职浪人“无幻”出手救了风。另一方面，地方官正在欺压老百姓，流浪武士“仁”路见不平拔剑相助，杀死了地方官身边的四个“高手”保镖，救下了穷人，因此得罪了地方官。
随后，无幻和仁在茶馆里相遇并交手，忽然一场大火将他们困住，二人随之被捕。因儿子在大火中丧生，恼羞成怒的地方官勒令将二人砍首。砍首之日二人大闹刑场，并且在风的帮助下，从刑场中逃出来了。作为代价，风要求他们一起去寻找一个身上“带着向日葵香味”的武士。从此，三人展开了一场奇幻的旅程。
《混沌武士》由渡边信一郎监督，全片彰显了独特的浮世绘加现代Hip-Hop风格。本动画获选为2004年第八回日本文部省文化厅媒体艺术祭动画部门推荐的作品。

在一千年前，人类和恶灵互相战斗着。人类借由圣兽的帮忙，远古的百兽战士大神月磨击败了欧陆克的领袖，而且封印了他。现在，欧陆克开始复苏，五个年轻人被圣兽认定。他们一定要放弃他们的现在生命而变成新一代的牙吠连者保护地球的和平。

故事发生在遥远的月球之上，彼时，那里已经变成了适宜人类居住的星球。某日，来月球旅行的遥大地（松冈洋子 配音）邂逅了名为“兔人”的月球种族，他们告诉遥大地，他们位于月球内层的星球遭到了邪动族的侵略都和霸占，为此，他们踏上了寻找能够对抗邪动族的勇士的旅程。
让兔人们没有想到的是，遥大地竟然就是他们要找的光明魔动战士，通过魔法阵，遥大地召唤出了地之魔动王。之后，召唤出风之魔动王的山本加斯（松田辰也 配音），召唤出水之魔动王的玛利乌斯（安达忍 配音）等人纷纷登场，一行人来到了圣地路那，准备在那里展开一段惊心动魄的奇幻旅程。

白滨兼一（关智一 配音）是一个为人和善性格懦弱的内向少年，因为这性格，兼一没少受同学的欺负。为了改变悲惨的现状，兼一决定改头换面重新做人，随即加入了学校的空手道部。没想到，在社团里，兼一的境遇并没有改变，因为被社员讨厌，兼一即将被驱逐出社团，唯一幸免于难的方法就是在于社员的比武中获胜，这对于兼一来说，几乎是不可能完成的任务。
名叫风林寺美羽（川上伦子 配音）的美少女出现在了兼一的面前，她告诉兼一，有一处名为梁山泊的道场聚集了无数的武林英雄豪杰。为了赢得比试，兼一走上了修炼的修罗之道，令他没想到的是，他平凡的人生即将被这一仓促的决定而彻底颠覆。

上月由香（椎名碧流 配音）是一名职业跳伞师，她的工作是确保客人们在进行跳伞运动时的人身安全。表面上看，由香的外表清新个性甜美，但是在这样的外表下，却隐藏了一个惊天秘密。由香的体内隐藏着怪物的基因，每当情绪激动时，这基因便会使由香变异成外表可怖的食人鬼，而由香无法控制食人 鬼的所作所为，很多人成为了她手下的牺牲品。在工作中，由香结识了性格老实正直的桃田俊彦（木内秀信 配音），两人一见钟情。可是，俊彦也有着自己的秘密，他居然是一名专门猎杀食人鬼的怪物猎人，这样敌对的两个人，开始了漫长而痛苦的爱情历程。
桃田一马（吉野裕行 配音）是俊彦的同行，他有着先进的思想和强大的行动力，某一日，俊彦和一马的父亲被怪物杀死了，而所有的矛头都指向了由香。为了生存，也为了洗脱罪名，由香和俊彦踏上了逃亡的路途。

A small, lone Kappa miraculously survives over 200 years into modern day Japan, when he is found by young Koichi. Coo, who is secretly adopted by Koichi's family, searches with his new human friend for unpopulated places in hopes of finding any remaining of his kind.