高町奈叶（田村由香里 配音）是一位平凡的高中三年级学生，某日，在上学的路上，她同来自异世界米德其路达的尤诺（水桥香织 配音）相遇了。尤诺告诉奈叶，她正在寻找遗落人间的太古遗产“圣石之种”，这种珍贵的宝物蕴藏着巨大的能量，如果弃之不顾有可能在人间界造成巨大的破坏，接二连三的波折之后，奈叶成为了帮助尤诺回收种子的魔法少女，开始了一段充满了危险和刺激的奇幻旅程。
某日，一位名叫菲特（水树奈奈 配音）的金发少女出现在了奈叶的面前，她和奈叶一样同为回收种子的魔法少女，也就是说，她们的关系是竞争者。奈叶能够打败这样一位强劲的对手吗？对于菲特来说，温柔而又努力的奈叶又是一种怎样的存在呢？

故事发生在美丽的小村庄村川村，时值暑期，夏纪、小周以及小清等五名小学生，在校舍里进行暑期合宿活动。为了找回失踪的宠物小兔，五人进入深山探寻，意外发现了深山里的神秘怪圈，而且还发现了一只受伤的小狗。被五人救下的小狗醒后居然开口说话，他自称是来自犬星的宇宙人，名字叫波奇，他来地球为了一种早已绝种的植物。
为了报答五人的救命之恩，波奇决定实现他们探索宇宙的愿望。于是，一个外形像小狗的外星人，以及五名小学生，展开了他们精彩纷呈的宇宙之旅。

凯特（富坂晶 配音）出生于富贵之家，贵为千金大小姐的她身上有着一种天然的领袖气质，能做到临危不乱。罗丝（辻步美 配音）沉默寡言，性格内向，沉静的外表之下隐藏了一颗睿智的心灵。蕾切尔（新谷良子 配音）奔放热情，身手矫捷。克莱尔（泽城美雪 配音）个性强硬，喜欢独来独往。四人均就读于同一所学校。
某日，一场意外夺走了她们共同的好友莉兹（福圆美里 配音）的生命，从灾难中脱险惊魂未定的姑娘们还来不及发现，她们的身体发生了某些诡异的变化。入夜，在神秘蝴蝶的带领下，四人来到了仓库街，在那里，她们邂逅了教官劳拉（田中理惠 配音），劳拉告诉一行人，她们早已经死去，为了继续存活在这个世界里，四个女孩要付出相应的代价。

“谷田部勇者三部作”之一，以少年高杉星史，以幪面人身份，与沉睡在地球的八名勇者开始。故事中设定的时间，是在“太阳勇者”之前九年。故事主要围绕高杉星史以隐藏身份，保卫地球的喜与悲为主线。
机械方面，除了主角泰丹X首次加上火车合体的概念外，当中的第九名勇者“七重变形体”，除了是首个非合体构成的勇者外，亦是第一个在故事中死亡而并无再次复活的角色。
剧情简介：某天，地球突然受到宇宙人的侵入，它们的目标是具有生命力的“行星能源”，于是宇宙侵略者“奥巴斯”对地球开始了攻击。它们不断收集行星能量集中到“解放点”然后将其进行攻击让地球发生大爆炸。就读日本海滨小学五年级的小学生“高杉星史”被地球的意志所呼唤，而成为了保护地球的地球勇者们的队长，而星史手上的“指挥仪”就是他的勇者队长之证。指挥仪发出呼唤，古寺里的佛像的宝珠—勇者之石跟警视厅的巡逻车融合后变成了机器人，传说中的勇者“泰丹”诞生，这时便开始了守护地球的长时间战争。

在“香兰堂”古董店打工的美术院学生仓桥永莉，被古老雕花玻璃杯中映出的金发碧眼的可爱少女吸引，秘密地享受着与这非人幻象邂逅的愉悦。香兰堂位于善导寺商店街地中心，那里出入的都是年轻美丽的女性，然而仓桥却没有任何兴趣，只是迷恋着玻璃杯中的少女。
第七天的夜里，在雕花玻璃杯里，永莉看见了自己将少女杀害的幻象。
然后，从玻璃杯中溢出鲜血，少女的幻象实体化，迫使永莉定下契约。这个名叫“柯婕特”的少女，要求永莉救出自己在“被诅咒器皿”中徘徊的灵魂。“喝下去，如果不想分离……如果不想失去我”，永莉被柯婕特强迫，喝下玻璃杯中鲜血定下“血之契约”。
过了一夜，醒来的永莉已经不能再看到玻璃杯中的柯婕特的身影，于是把这一切当作是梦，重新振作，将玻璃杯卖给了暴发户的富豪。然而，去富豪家中交货时，在那里永莉看见了实体化的柯婕特。回到家中，永莉抑止不住想见柯婕特的心情，再次来到富豪的家中，然而在那里的是已变成尸体的富豪及其情人......
目击柯婕特临死状态的“被诅咒器皿”中的玻璃杯，吸取了富豪他们的鲜血，杀死了他们。之后，这个玻璃杯的怨念附在永莉身上，想要夺其性命......

西元2133年，世界陷入荒芜与混乱，愚蠢的人类亲手用核武器摧毁了自己赖以居住的场所。硝烟与战火散尽之后，孕育着希望的新城奥林帕斯建立起来，高科技的产物生化人 隆重登场，充当着服务人类的重任，而ESWAT则担负起保卫世界和平的重任。在一次执行任务中，布里艾诺斯（山寺宏一 配音）为保护女友迪娜•纳兹（小林爱 配音）而身受重伤，之后ESWAT高层利用布里艾诺斯的基因制作了生化人特雷斯，并让他和迪娜组成新的搭档。虽然颇有抵触，但在一段时间的相处后，迪娜内心深处悄悄发生着变化。
与此同时，各地接连发生机器人失控危及人类的情况，而他们使用的武器全部指向了重工业最大生产国波塞冬。奥利帕斯高层研究加强对通信卫星的监控，突然之间，ESWAT内部经过改造的半机械人也失去控制。新的危机呈现，迪娜面临重大的抉择……

半年前的一连串遭遇，彻底改变了三年级小学生高町奈叶（田村由香里 配音）的人生，她以魔法少女的身份邂逅了可爱的小伙伴尤诺·斯克莱亚（水桥香织 饰），并通过连番激战与深锁着无数秘密和烦恼的菲特·泰斯特罗莎（水树奈奈 配音）成为莫逆好友。新学期开始，菲特以小学生的身份转入奈叶的班级，一切看似进入了平稳期。克就在某个毫无征兆的夜晚，奈叶和菲特遭到手持暗之书的维塔（真田麻美 配音）等三名违法渡行者的袭击，她们的魔导器也被破坏。
新的危机，新的对手，一切朝着不可预知的方向发展……