《孙文与日本史事编年（增订本）》是一部资料性很强的书，但又不是资料汇编。它既容纳了方方面面的资料，又简明扼要、有序可寻，便于查阅。段云章教授对浩繁的资料进行了认真的研究、剪裁和处理，剔其重叠，删其芜杂，考其异同，力求史实的准确，堪称披沙拣金。从而，这部书既有可以放心使用的可信性、可靠性，又具有简洁、清晰的可读性。

本书直面现今国人科学概念的误区，即要么把科学等同于技术，等同于促进生产力发展的工具，要么把科学看成一种普遍存在的人类智力成就。作者指出：科学成为推动历史发展的强大动力只是十九世纪以后的现象，科学根源于希腊人对于自由人性的追求，因而是一种十分罕见的文化现象。现代科学起源于 希腊科学的复兴以及基督教内在的思想运动，对力量的追求、对自然的控制和征服成为现代科学的主导动机。在数理实验科学的意义上，中国古代并无科学。在博物学的意义上，中国古代有独特且强大的科学传统。