《总务二科》改编自安田弘之同名漫画作品“总务二科”。
在日本，大型机构必有一个部门，负责派发、更换厕纸、换日光灯等工作，而这个杂务部门的名称为：总务二科。这个部分虽被公司认为是垃圾，却聚集了六位不同原因被贬到此部门的女职员因：主张女人的价值在于交往过的男人总数的千夏（江角真纪子 饰）、对男人有致命吸引力的佳奈（樱井淳子 饰）、理财高手小梓（户田惠子 饰）、准确率具威胁性的算命师理绘（高乔由美子 饰）、做事不得窍门的佐和子（京野琴美 饰）、做事总出纰漏的小梅（宝生舞饰演）。她们究竟会在这个被称为“女性坟墓”的部门发生怎样的故事呢？

人总是等到失去后才知道珍惜，如果可以从头来过，是否就可以弥补缺憾，达成心愿？
岩瀬健（山下智久饰）和吉田礼（長澤まさみ饰）是从小学就在一起玩的青梅竹马，明明对彼此都心存好感，就只差说出“喜欢”二字，可是礼最后怎么就成了多田老师（藤木直人饰）的新娘？
直到站在礼的婚礼宴席上，健才感到了一种追悔莫及的悲痛，这股强烈的情感引来了妖精（三上博史饰），妖精施展魔法帮助健回到过去，改写历史，可是纵使一次又一次地穿越，健的始终踌躇不前，礼的始终欲言又止，使两人的关系终无突破性变化。
最后，健突然意识到让心爱的人幸福也是一种快乐，他放弃时空穿梭，在宴席上向礼献上最诚挚的祝福……

蓝田美知留（长泽雅美 饰）在美容院担任助手工作，时常遭受同事非难。回到家里，又要面对酗酒和带男人回家的母亲。对她而言，生活是一团烂泥。于是当男友及川宗佑（锦户亮 饰）提出同居的请求时，她怀着对未来的憧憬答应了。
美知留为新家购置生活用品时，浑然不觉身后岸本瑠可（上野树里 饰）惊见的目光。瑠可为了追上坐班车的美知留，不小心撞到了在家居店里就留意她的水岛武（瑛太 饰）。瑠可和美知留是中学同学，瑠可心里怀着一个不能言说的秘密，追上美知留后，二人开怀畅聚。如今瑠可和朋友绘梨住在share house里，听到美知留幸福地讲述要和男友同居时，瑠可眼里划过一丝复杂的感情。
然而幸福并没有降临到美知留身上，宗佑由于多疑和敏感查看美知留的手机留言，误会瑠可是男人而对美知留大动拳脚，逃出来的美知留本能地拨打了瑠可的电话。瑠可把她带回share house，发现小武也正要加入SH。四个年轻人聚集在一个屋檐下，怀着对未来的希望，又带着各自的困题，将要上演自己都不能预料的人生戏剧。

柏木达也（江口洋介饰）自马拉松退役后，打算回乡下结婚，开始新的人生。同时，他也打算找回四散各地的弟弟妹妹——7年前父母双亡后，兄弟们便天各一方。
7年的时空间隔，如今，每个人有着截然不同的际遇：和上司有不伦关系的小雪（酒井法子饰）、被医院院长收为养子的雅也（福山雅治饰）、混迹街头的不良少年和也（いしだ壹成饰）、高中生小梅（大路惠美饰）和因事故而双腿残疾的文也（山本耕史饰）。纵使是亲人也难免心生嫌隙……
可达也决心承担起家庭的重担，无论如何也要让大家重新团聚在一起，他克服了重重困难，甚至牺牲了自己的婚事……
于是，手足6人终于聚在“同一屋檐下”，一个事故和意外频生，拌嘴和冲突不断，但是同时也是充满了欢声笑语的温馨家庭的平凡故事就此上演。

广濑未知(松岛菜菜子 饰)对教师一职失去热情，而光(泷泽秀明 饰) 被母亲镜子(黑木瞳 饰)严格要求继承医院家业，他们俩人第一次相遇就是在彼此生活都陷入绝境时。未知当时只想与未婚夫结婚，以逃避学校的一切，一心辞去教师的工作。而就在这时，光转入了未知的班上，光当时正想逃离母亲镜子的束缚，为此苦恼不已。纯洁得似乎一碰即碎的光，强烈地吸引著未知，而光对未知也怀著同样的情愫。未知在俩人相识之初，由于自己与光是教师与学生的关系，她只能拼命地压抑著自己的爱意，但是光对未知毫无保留、勇敢的爱情，让未知再也无法沉默，心中的疑虑及恐惧一扫而空。但是来自各界的压力不断，他们自己的相互磨合又总是不合时宜地发生，两人在艰难的经历和环境中，历经了多次的分分合合。这段惊世骇俗的师生恋情是否能被被周围的人认可？最终他们是否可以走向了幸福？

从爱媛乡下来到大城市东京的广告代理店工作的永尾完治（织田裕二饰）忐忑地走出机场，迎接她的是公司女同事，海归女性赤名莉香（铃木保奈美饰）的笑颜与“丸子”的爱称。（日文中“完治”与“丸子”谐音。）老实的完治工作踏实，很快得到了莉香的表白。但他心中却有另一个女人。
同学会上， 完治与老同学关口里美（有森也实饰）、三上健一（江口洋介饰）相遇。完治发现自己暗恋的里美在与好友三上交往，苦闷的他不知道，三上只是怀着玩的心态与里美交往，实际上三上喜欢的是医学院的女学生长崎尚子（千堂秋穗饰）。
五个人的感情纠葛，东京城市下渴望爱的一个个灵魂。完治会选择热情奔放的莉香，还是传统女性的里美呢？