杀人越货的罪犯连续神秘死亡，人们将替天行道惩治恶人的基拉奉为救世主，警方对之束手无策。专门解决奇诡事件的天才少年L推断，基拉有97%的可能性身在日本，于是他离开洛杉矶飞赴日本。临行之前，L心中浮起淡淡的预感——自己可能再也回不来了。L与基拉——夜神月的展开了正面交锋。这时，泰国的一个小村庄被人从大地上抹去了痕迹。L并不知道有一桩足以毁灭世界的重大阴谋正在酝酿之中。L以自己的生命为代价设下陷阱准备一举击溃夜神月。不料，多年的搭档老渡意外身亡。L决定在自己最后的23天中解决老渡所留下的任务。直升机送来了一箱给老渡的礼物，里面竟是一个男孩——他是遭灭顶之灾的泰国小村的唯一幸存者。L从男孩随身携带的磁碟资料中得知，该事件与恐怖的杀人病毒有关。此时，少女真希带着父亲的遗物来找老渡，她也是这场阴谋的受害者。追踪而来的杀手已然赶到，L带着两个孩子开始了逃亡。还剩下6天，一向不擅长户外活动又失去了左膀右臂的L能否脱离危机？能否消灭人类制造可怕的死神？

新学期开始，升入六年级的小朋友们迎来了一位新老师阿久津真矢（天海祐希饰），第一节课，不苟言笑的真矢老师便发了一通关于社会不公和残酷性的评论，表示今后要在班里实行差别待遇，唯一的衡量标准是每周的考试成绩。
神田和美（志田未来饰）对老师的高压政策十分不以为然，她和捣蛋鬼真锅由介（松川尚王留辉饰）总是和老师唱对台戏，而后果就是被整得死惨。在一次惩罚中，优等生进藤光（福田麻由子饰）为和美求情，却被真矢一起惩罚。不久，光也加入到和美的队伍中，三人一起反抗老师。
真矢冷酷无比的教育方针渐渐引起所有同学的恐慌，他们计划着共同推翻真矢的管制，让她下台……