圣诞节临近，狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 David Schwimmer 配音）以及河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 Jada Pinkett Smith 配音）决定正式告别马达加斯加，回到久违的纽约共度佳节。冷冷清清的送别晚会没能熄灭它们归去的热情，好伙伴们燃起热气球正式出发，可是却被狐猴王朱利安当作红色妖盗击落下来。不久，真的红色妖盗出现夜空，混乱之中亚历克斯阴差阳错将其打落，结果却发现所谓的红色妖盗竟然是圣诞老人！倒霉的是圣诞老人被砸失忆，为了不让全世界小朋友失望，亚历克斯他们和企鹅帮决定充当圣诞老人的助手，将礼物送到世界每一个角落。

狮子亚历克斯他们在马达加斯加的快乐故事仍在继续。而另一边厢，那四只调皮捣蛋的企鹅：沉着冷静的老大（Tom McGrath 配音）、脑瓜机灵的技术狂卡哇伊（Jeff Bennett 配音）、单纯而超梦的菜鸟（James Patrick Stuart 配音）以及疯狂危险的凉快（John DiMaggio 配音）却回到了纽约动物园。虽然平时被关在笼中，但这根本难不住技能互补的企鹅四兄弟，在繁华的国际大都会，他们还是可以让演一场又一场令人咋舌又拍案叫绝的大冒险。此外，超级自恋狂狐猴朱利安国王14世和大毛也告别老家，携手到陌生的美国闯天下。动物、人类，原始、文明，彼此间发生激烈碰撞，有趣的故事接连上演……
本片为动画电影《马达加斯加》的衍生剧。